Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gsc2P56916 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gsc2P56916 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gsc2P56916 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gsc2P56916 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gsc2P56916 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gsc2P56916 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gsc2P56916 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gsc2P56916 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gsc2P56916 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gsc2P56916 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gsc2P56916 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gsc2P56916 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gsc2P56916 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gsc2P56916 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gsc2P56916 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Gsc2P56916 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Gsc2P56916 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gsc2P56916 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gsc2P56916 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Gsc2P56916 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gsc2P56916 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gsc2P56916 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gsc2P56916 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gsc2P56916 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gsc2P56916 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gsc2P56916 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gsc2P56916 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gsc2P56916 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gsc2P56916 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gsc2P56916 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gsc2P56916 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gsc2P56916 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gsc2P56916 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gsc2P56916 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gsc2P56916 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gsc2P56916 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gsc2P56916 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gsc2P56916 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gsc2P56916 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gsc2P56916 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gsc2P56916 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gsc2P56916 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gsc2P56916 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gsc2P56916 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gsc2P56916 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gsc2P56916 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gsc2P56916 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gsc2P56916 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Gsc2P56916 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gsc2P56916 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gsc2P56916 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gsc2P56916 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gsc2P56916 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gsc2P56916 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gsc2P56916 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gsc2P56916 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gsc2P56916 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gsc2P56916 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gsc2P56916 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gsc2P56916 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gsc2P56916 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gsc2P56916 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gsc2P56916 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gsc2P56916 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gsc2P56916 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gsc2P56916 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gsc2P56916 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gsc2P56916 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gsc2P56916 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gsc2P56916 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gsc2P56916 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gsc2P56916 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gsc2P56916 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gsc2P56916 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gsc2P56916 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Gsc2P56916 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gsc2P56916 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gsc2P56916 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gsc2P56916 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gsc2P56916 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gsc2P56916 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gsc2P56916 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gsc2P56916 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gsc2P56916 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gsc2P56916 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gsc2P56916 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gsc2P56916 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gsc2P56916 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gsc2P56916 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gsc2P56916 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gsc2P56916 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gsc2P56916 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gsc2P56916 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gsc2P56916 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gsc2P56916 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gsc2P56916 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gsc2P56916 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gsc2P56916 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Gsc2P56916 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms