Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lim2P56563 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lim2P56563 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lim2P56563 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lim2P56563 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lim2P56563 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lim2P56563 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Lim2P56563 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lim2P56563 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lim2P56563 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lim2P56563 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lim2P56563 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lim2P56563 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lim2P56563 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lim2P56563 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lim2P56563 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lim2P56563 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lim2P56563 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lim2P56563 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lim2P56563 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Lim2P56563 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Lim2P56563 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lim2P56563 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lim2P56563 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lim2P56563 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lim2P56563 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lim2P56563 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lim2P56563 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lim2P56563 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lim2P56563 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lim2P56563 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lim2P56563 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lim2P56563 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lim2P56563 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lim2P56563 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lim2P56563 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lim2P56563 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lim2P56563 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lim2P56563 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lim2P56563 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Lim2P56563 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lim2P56563 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lim2P56563 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lim2P56563 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Lim2P56563 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lim2P56563 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Lim2P56563 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lim2P56563 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lim2P56563 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lim2P56563 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lim2P56563 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lim2P56563 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Lim2P56563 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lim2P56563 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Lim2P56563 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lim2P56563 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lim2P56563 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lim2P56563 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lim2P56563 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lim2P56563 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lim2P56563 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lim2P56563 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lim2P56563 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lim2P56563 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Lim2P56563 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lim2P56563 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lim2P56563 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lim2P56563 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lim2P56563 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lim2P56563 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lim2P56563 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lim2P56563 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lim2P56563 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lim2P56563 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lim2P56563 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lim2P56563 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lim2P56563 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lim2P56563 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lim2P56563 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lim2P56563 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lim2P56563 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lim2P56563 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lim2P56563 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lim2P56563 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lim2P56563 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lim2P56563 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lim2P56563 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lim2P56563 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Lim2P56563 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lim2P56563 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lim2P56563 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Lim2P56563 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lim2P56563 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lim2P56563 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lim2P56563 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lim2P56563 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lim2P56563 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lim2P56563 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lim2P56563 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lim2P56563 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms