Protein–RNA interactions for Protein: P56546

Ctbp2, C-terminal-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctbp2P56546 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctbp2P56546 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctbp2P56546 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctbp2P56546 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctbp2P56546 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctbp2P56546 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctbp2P56546 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctbp2P56546 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctbp2P56546 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctbp2P56546 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctbp2P56546 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctbp2P56546 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctbp2P56546 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctbp2P56546 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctbp2P56546 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctbp2P56546 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctbp2P56546 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctbp2P56546 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctbp2P56546 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctbp2P56546 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctbp2P56546 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctbp2P56546 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctbp2P56546 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctbp2P56546 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctbp2P56546 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctbp2P56546 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctbp2P56546 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ctbp2P56546 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ctbp2P56546 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctbp2P56546 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctbp2P56546 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctbp2P56546 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctbp2P56546 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctbp2P56546 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctbp2P56546 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctbp2P56546 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctbp2P56546 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctbp2P56546 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctbp2P56546 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctbp2P56546 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctbp2P56546 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctbp2P56546 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctbp2P56546 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctbp2P56546 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctbp2P56546 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctbp2P56546 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctbp2P56546 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctbp2P56546 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctbp2P56546 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctbp2P56546 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctbp2P56546 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctbp2P56546 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ctbp2P56546 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctbp2P56546 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctbp2P56546 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctbp2P56546 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctbp2P56546 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctbp2P56546 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctbp2P56546 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctbp2P56546 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctbp2P56546 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctbp2P56546 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctbp2P56546 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctbp2P56546 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctbp2P56546 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctbp2P56546 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctbp2P56546 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctbp2P56546 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctbp2P56546 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctbp2P56546 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctbp2P56546 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctbp2P56546 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctbp2P56546 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctbp2P56546 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctbp2P56546 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctbp2P56546 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctbp2P56546 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctbp2P56546 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctbp2P56546 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctbp2P56546 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctbp2P56546 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctbp2P56546 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctbp2P56546 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctbp2P56546 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctbp2P56546 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctbp2P56546 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctbp2P56546 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctbp2P56546 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctbp2P56546 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctbp2P56546 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctbp2P56546 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctbp2P56546 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctbp2P56546 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctbp2P56546 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctbp2P56546 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctbp2P56546 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctbp2P56546 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctbp2P56546 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctbp2P56546 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctbp2P56546 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms