Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Irf5P56477 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Irf5P56477 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Irf5P56477 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Irf5P56477 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Irf5P56477 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Irf5P56477 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Irf5P56477 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Irf5P56477 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Irf5P56477 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Irf5P56477 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Irf5P56477 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Irf5P56477 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Irf5P56477 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Irf5P56477 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Irf5P56477 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Irf5P56477 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Irf5P56477 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Irf5P56477 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Irf5P56477 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Irf5P56477 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Irf5P56477 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Irf5P56477 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Irf5P56477 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Irf5P56477 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Irf5P56477 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Irf5P56477 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Irf5P56477 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Irf5P56477 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Irf5P56477 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Irf5P56477 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Irf5P56477 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Irf5P56477 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Irf5P56477 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Irf5P56477 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Irf5P56477 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Irf5P56477 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Irf5P56477 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Irf5P56477 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Irf5P56477 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Irf5P56477 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Irf5P56477 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Irf5P56477 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Irf5P56477 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Irf5P56477 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Irf5P56477 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Irf5P56477 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Irf5P56477 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Irf5P56477 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Irf5P56477 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Irf5P56477 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Irf5P56477 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Irf5P56477 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Irf5P56477 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Irf5P56477 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Irf5P56477 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Irf5P56477 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Irf5P56477 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Irf5P56477 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Irf5P56477 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Irf5P56477 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Irf5P56477 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Irf5P56477 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Irf5P56477 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Irf5P56477 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Irf5P56477 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Irf5P56477 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Irf5P56477 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Irf5P56477 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Irf5P56477 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Irf5P56477 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Irf5P56477 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Irf5P56477 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Irf5P56477 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Irf5P56477 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Irf5P56477 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Irf5P56477 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Irf5P56477 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Irf5P56477 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Irf5P56477 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Irf5P56477 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Irf5P56477 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Irf5P56477 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Irf5P56477 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Irf5P56477 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Irf5P56477 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Irf5P56477 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Irf5P56477 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Irf5P56477 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Irf5P56477 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Irf5P56477 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Irf5P56477 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Irf5P56477 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Irf5P56477 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Irf5P56477 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Irf5P56477 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Irf5P56477 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Irf5P56477 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Irf5P56477 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Irf5P56477 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms