Protein–RNA interactions for Protein: P55249

Alox12e, Arachidonate 12-lipoxygenase, epidermal-type, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alox12eP55249 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Alox12eP55249 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Alox12eP55249 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Alox12eP55249 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Alox12eP55249 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Alox12eP55249 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Alox12eP55249 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Alox12eP55249 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Alox12eP55249 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Alox12eP55249 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Alox12eP55249 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Alox12eP55249 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Alox12eP55249 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Alox12eP55249 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Alox12eP55249 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Alox12eP55249 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Alox12eP55249 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Alox12eP55249 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Alox12eP55249 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Alox12eP55249 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Alox12eP55249 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Alox12eP55249 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Alox12eP55249 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Alox12eP55249 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Alox12eP55249 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Alox12eP55249 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Alox12eP55249 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Alox12eP55249 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Alox12eP55249 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Alox12eP55249 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Alox12eP55249 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Alox12eP55249 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Alox12eP55249 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Alox12eP55249 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Alox12eP55249 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Alox12eP55249 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Alox12eP55249 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Alox12eP55249 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Alox12eP55249 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Alox12eP55249 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Alox12eP55249 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Alox12eP55249 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Alox12eP55249 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Alox12eP55249 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Alox12eP55249 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Alox12eP55249 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Alox12eP55249 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Alox12eP55249 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Alox12eP55249 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Alox12eP55249 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Alox12eP55249 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Alox12eP55249 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Alox12eP55249 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Alox12eP55249 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Alox12eP55249 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Alox12eP55249 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Alox12eP55249 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Alox12eP55249 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Alox12eP55249 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Alox12eP55249 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Alox12eP55249 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Alox12eP55249 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Alox12eP55249 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Alox12eP55249 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Alox12eP55249 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Alox12eP55249 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Alox12eP55249 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Alox12eP55249 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Alox12eP55249 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Alox12eP55249 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Alox12eP55249 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Alox12eP55249 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Alox12eP55249 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Alox12eP55249 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Alox12eP55249 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Alox12eP55249 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Alox12eP55249 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Alox12eP55249 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Alox12eP55249 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Alox12eP55249 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Alox12eP55249 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Alox12eP55249 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Alox12eP55249 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Alox12eP55249 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Alox12eP55249 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Alox12eP55249 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Alox12eP55249 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Alox12eP55249 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Alox12eP55249 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Alox12eP55249 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Alox12eP55249 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Alox12eP55249 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Alox12eP55249 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Alox12eP55249 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Alox12eP55249 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Alox12eP55249 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Alox12eP55249 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Alox12eP55249 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Alox12eP55249 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Alox12eP55249 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 549.4 ms