Protein–RNA interactions for Protein: P55098

Pex2, Peroxisome biogenesis factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex2P55098 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pex2P55098 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pex2P55098 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pex2P55098 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pex2P55098 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pex2P55098 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pex2P55098 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pex2P55098 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pex2P55098 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pex2P55098 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pex2P55098 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pex2P55098 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pex2P55098 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pex2P55098 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pex2P55098 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pex2P55098 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pex2P55098 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pex2P55098 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pex2P55098 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pex2P55098 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pex2P55098 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pex2P55098 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pex2P55098 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Pex2P55098 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pex2P55098 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pex2P55098 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pex2P55098 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pex2P55098 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pex2P55098 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pex2P55098 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Pex2P55098 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pex2P55098 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pex2P55098 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pex2P55098 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pex2P55098 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pex2P55098 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pex2P55098 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pex2P55098 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pex2P55098 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pex2P55098 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pex2P55098 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pex2P55098 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pex2P55098 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pex2P55098 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Pex2P55098 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pex2P55098 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pex2P55098 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Pex2P55098 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pex2P55098 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pex2P55098 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pex2P55098 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pex2P55098 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pex2P55098 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pex2P55098 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pex2P55098 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pex2P55098 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pex2P55098 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pex2P55098 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pex2P55098 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pex2P55098 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pex2P55098 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pex2P55098 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pex2P55098 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pex2P55098 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pex2P55098 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Pex2P55098 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pex2P55098 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pex2P55098 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pex2P55098 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pex2P55098 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pex2P55098 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pex2P55098 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Pex2P55098 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pex2P55098 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pex2P55098 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pex2P55098 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pex2P55098 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pex2P55098 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Pex2P55098 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pex2P55098 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pex2P55098 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pex2P55098 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pex2P55098 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pex2P55098 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pex2P55098 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pex2P55098 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pex2P55098 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pex2P55098 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pex2P55098 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pex2P55098 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pex2P55098 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pex2P55098 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pex2P55098 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pex2P55098 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pex2P55098 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pex2P55098 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pex2P55098 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Pex2P55098 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pex2P55098 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pex2P55098 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms