Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Aqp4P55088 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Aqp4P55088 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Aqp4P55088 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Aqp4P55088 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Aqp4P55088 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Aqp4P55088 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Aqp4P55088 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Aqp4P55088 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Aqp4P55088 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Aqp4P55088 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Aqp4P55088 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Aqp4P55088 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Aqp4P55088 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Aqp4P55088 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Aqp4P55088 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Aqp4P55088 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Aqp4P55088 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Aqp4P55088 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Aqp4P55088 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Aqp4P55088 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Aqp4P55088 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Aqp4P55088 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Aqp4P55088 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Aqp4P55088 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Aqp4P55088 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Aqp4P55088 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Aqp4P55088 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Aqp4P55088 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Aqp4P55088 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Aqp4P55088 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Aqp4P55088 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Aqp4P55088 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Aqp4P55088 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Aqp4P55088 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Aqp4P55088 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Aqp4P55088 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Aqp4P55088 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Aqp4P55088 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Aqp4P55088 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Aqp4P55088 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Aqp4P55088 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Aqp4P55088 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Aqp4P55088 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Aqp4P55088 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Aqp4P55088 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Aqp4P55088 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Aqp4P55088 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Aqp4P55088 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Aqp4P55088 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Aqp4P55088 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Aqp4P55088 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Aqp4P55088 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Aqp4P55088 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Aqp4P55088 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Aqp4P55088 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Aqp4P55088 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Aqp4P55088 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Aqp4P55088 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Aqp4P55088 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Aqp4P55088 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Aqp4P55088 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Aqp4P55088 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Aqp4P55088 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Aqp4P55088 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Aqp4P55088 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Aqp4P55088 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Aqp4P55088 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Aqp4P55088 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Aqp4P55088 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Aqp4P55088 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Aqp4P55088 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Aqp4P55088 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Aqp4P55088 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Aqp4P55088 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Aqp4P55088 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Aqp4P55088 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Aqp4P55088 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Aqp4P55088 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Aqp4P55088 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Aqp4P55088 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Aqp4P55088 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Aqp4P55088 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Aqp4P55088 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Aqp4P55088 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Aqp4P55088 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Aqp4P55088 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Aqp4P55088 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Aqp4P55088 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Aqp4P55088 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Aqp4P55088 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Aqp4P55088 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Aqp4P55088 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Aqp4P55088 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Aqp4P55088 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Aqp4P55088 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Aqp4P55088 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Aqp4P55088 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Aqp4P55088 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Aqp4P55088 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms