Protein–RNA interactions for Protein: P53395

Dbt, Lipoamide acyltransferase component of branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase complex, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbtP53395 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DbtP53395 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DbtP53395 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DbtP53395 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DbtP53395 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DbtP53395 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DbtP53395 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DbtP53395 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DbtP53395 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DbtP53395 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DbtP53395 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DbtP53395 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DbtP53395 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DbtP53395 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DbtP53395 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DbtP53395 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DbtP53395 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DbtP53395 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DbtP53395 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DbtP53395 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DbtP53395 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DbtP53395 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DbtP53395 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DbtP53395 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DbtP53395 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DbtP53395 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DbtP53395 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DbtP53395 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DbtP53395 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DbtP53395 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DbtP53395 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DbtP53395 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
DbtP53395 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DbtP53395 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DbtP53395 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DbtP53395 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DbtP53395 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DbtP53395 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DbtP53395 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DbtP53395 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DbtP53395 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DbtP53395 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DbtP53395 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DbtP53395 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DbtP53395 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
DbtP53395 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DbtP53395 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DbtP53395 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DbtP53395 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DbtP53395 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DbtP53395 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DbtP53395 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DbtP53395 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DbtP53395 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DbtP53395 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DbtP53395 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DbtP53395 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DbtP53395 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DbtP53395 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DbtP53395 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DbtP53395 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DbtP53395 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DbtP53395 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DbtP53395 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DbtP53395 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DbtP53395 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
DbtP53395 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DbtP53395 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
DbtP53395 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DbtP53395 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DbtP53395 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
DbtP53395 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DbtP53395 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DbtP53395 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DbtP53395 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DbtP53395 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DbtP53395 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DbtP53395 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DbtP53395 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DbtP53395 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DbtP53395 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DbtP53395 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DbtP53395 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DbtP53395 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DbtP53395 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DbtP53395 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DbtP53395 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DbtP53395 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DbtP53395 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
DbtP53395 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DbtP53395 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DbtP53395 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DbtP53395 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DbtP53395 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DbtP53395 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DbtP53395 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DbtP53395 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DbtP53395 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DbtP53395 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DbtP53395 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms