Protein–RNA interactions for Protein: P50707

Defa9, Alpha-defensin 9, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa9P50707 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0,47
Defa9P50707 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0,47
Defa9P50707 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0,47
Defa9P50707 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0,47
Defa9P50707 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0,47
Defa9P50707 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,99■□□□□ 0,47
Defa9P50707 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC17,99■□□□□ 0,47
Defa9P50707 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17,99■□□□□ 0,47
Defa9P50707 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17,98■□□□□ 0,47
Defa9P50707 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,98■□□□□ 0,47
Defa9P50707 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17,98■□□□□ 0,47
Defa9P50707 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,98■□□□□ 0,47
Defa9P50707 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,97■□□□□ 0,47
Defa9P50707 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,97■□□□□ 0,47
Defa9P50707 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,97■□□□□ 0,47
Defa9P50707 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,96■□□□□ 0,47
Defa9P50707 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17,96■□□□□ 0,47
Defa9P50707 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,96■□□□□ 0,47
Defa9P50707 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,96■□□□□ 0,46
Defa9P50707 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17,95■□□□□ 0,46
Defa9P50707 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC17,95■□□□□ 0,46
Defa9P50707 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC17,94■□□□□ 0,46
Defa9P50707 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17,93■□□□□ 0,46
Defa9P50707 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC17,93■□□□□ 0,46
Defa9P50707 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,92■□□□□ 0,46
Defa9P50707 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,92■□□□□ 0,46
Defa9P50707 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17,92■□□□□ 0,46
Defa9P50707 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17,91■□□□□ 0,46
Defa9P50707 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17,9■□□□□ 0,46
Defa9P50707 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC17,9■□□□□ 0,46
Defa9P50707 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17,9■□□□□ 0,46
Defa9P50707 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17,9■□□□□ 0,46
Defa9P50707 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,89■□□□□ 0,45
Defa9P50707 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,89■□□□□ 0,45
Defa9P50707 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17,89■□□□□ 0,45
Defa9P50707 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,88■□□□□ 0,45
Defa9P50707 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC17,88■□□□□ 0,45
Defa9P50707 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC17,88■□□□□ 0,45
Defa9P50707 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,88■□□□□ 0,45
Defa9P50707 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,88■□□□□ 0,45
Defa9P50707 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC17,87■□□□□ 0,45
Defa9P50707 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,87■□□□□ 0,45
Defa9P50707 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,87■□□□□ 0,45
Defa9P50707 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,87■□□□□ 0,45
Defa9P50707 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,87■□□□□ 0,45
Defa9P50707 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,87■□□□□ 0,45
Defa9P50707 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17,86■□□□□ 0,45
Defa9P50707 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,85■□□□□ 0,45
Defa9P50707 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC17,84■□□□□ 0,45
Defa9P50707 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,84■□□□□ 0,45
Defa9P50707 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17,84■□□□□ 0,45
Defa9P50707 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,84■□□□□ 0,45
Defa9P50707 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,82■□□□□ 0,44
Defa9P50707 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17,82■□□□□ 0,44
Defa9P50707 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17,82■□□□□ 0,44
Defa9P50707 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17,82■□□□□ 0,44
Defa9P50707 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,82■□□□□ 0,44
Defa9P50707 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,82■□□□□ 0,44
Defa9P50707 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,82■□□□□ 0,44
Defa9P50707 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17,82■□□□□ 0,44
Defa9P50707 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,81■□□□□ 0,44
Defa9P50707 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17,81■□□□□ 0,44
Defa9P50707 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17,81■□□□□ 0,44
Defa9P50707 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC17,81■□□□□ 0,44
Defa9P50707 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC17,81■□□□□ 0,44
Defa9P50707 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,8■□□□□ 0,44
Defa9P50707 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,8■□□□□ 0,44
Defa9P50707 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,8■□□□□ 0,44
Defa9P50707 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,8■□□□□ 0,44
Defa9P50707 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,79■□□□□ 0,44
Defa9P50707 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,79■□□□□ 0,44
Defa9P50707 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,78■□□□□ 0,44
Defa9P50707 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,78■□□□□ 0,44
Defa9P50707 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,77■□□□□ 0,44
Defa9P50707 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17,77■□□□□ 0,44
Defa9P50707 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,77■□□□□ 0,43
Defa9P50707 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,76■□□□□ 0,43
Defa9P50707 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,75■□□□□ 0,43
Defa9P50707 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,75■□□□□ 0,43
Defa9P50707 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17,75■□□□□ 0,43
Defa9P50707 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC17,75■□□□□ 0,43
Defa9P50707 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,75■□□□□ 0,43
Defa9P50707 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,74■□□□□ 0,43
Defa9P50707 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,74■□□□□ 0,43
Defa9P50707 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,74■□□□□ 0,43
Defa9P50707 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,73■□□□□ 0,43
Defa9P50707 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,73■□□□□ 0,43
Defa9P50707 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,73■□□□□ 0,43
Defa9P50707 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,72■□□□□ 0,43
Defa9P50707 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,72■□□□□ 0,43
Defa9P50707 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17,72■□□□□ 0,43
Defa9P50707 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,72■□□□□ 0,43
Defa9P50707 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,71■□□□□ 0,43
Defa9P50707 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,71■□□□□ 0,43
Defa9P50707 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,71■□□□□ 0,43
Defa9P50707 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,71■□□□□ 0,42
Defa9P50707 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,7■□□□□ 0,42
Defa9P50707 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,7■□□□□ 0,42
Defa9P50707 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17,69■□□□□ 0,42
Defa9P50707 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,69■□□□□ 0,42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18,3 ms