Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TspoP50637 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TspoP50637 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TspoP50637 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TspoP50637 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TspoP50637 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TspoP50637 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TspoP50637 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TspoP50637 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TspoP50637 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TspoP50637 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TspoP50637 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TspoP50637 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TspoP50637 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TspoP50637 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
TspoP50637 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TspoP50637 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TspoP50637 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TspoP50637 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
TspoP50637 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TspoP50637 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TspoP50637 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TspoP50637 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TspoP50637 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
TspoP50637 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TspoP50637 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TspoP50637 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TspoP50637 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TspoP50637 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TspoP50637 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TspoP50637 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TspoP50637 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TspoP50637 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TspoP50637 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TspoP50637 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TspoP50637 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TspoP50637 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TspoP50637 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TspoP50637 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TspoP50637 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TspoP50637 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TspoP50637 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TspoP50637 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TspoP50637 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TspoP50637 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TspoP50637 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TspoP50637 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TspoP50637 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TspoP50637 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TspoP50637 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TspoP50637 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TspoP50637 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TspoP50637 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TspoP50637 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TspoP50637 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TspoP50637 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TspoP50637 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TspoP50637 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TspoP50637 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TspoP50637 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TspoP50637 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TspoP50637 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TspoP50637 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TspoP50637 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TspoP50637 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TspoP50637 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TspoP50637 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TspoP50637 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TspoP50637 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TspoP50637 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TspoP50637 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TspoP50637 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TspoP50637 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TspoP50637 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TspoP50637 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TspoP50637 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TspoP50637 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TspoP50637 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TspoP50637 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TspoP50637 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TspoP50637 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TspoP50637 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TspoP50637 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TspoP50637 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TspoP50637 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TspoP50637 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TspoP50637 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TspoP50637 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TspoP50637 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TspoP50637 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TspoP50637 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TspoP50637 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TspoP50637 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TspoP50637 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TspoP50637 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TspoP50637 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TspoP50637 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TspoP50637 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TspoP50637 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TspoP50637 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms