Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Hoxc13P50207 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Hoxc13P50207 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Hoxc13P50207 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Hoxc13P50207 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Hoxc13P50207 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Hoxc13P50207 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Hoxc13P50207 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Hoxc13P50207 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Hoxc13P50207 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Hoxc13P50207 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Hoxc13P50207 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Hoxc13P50207 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Hoxc13P50207 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Hoxc13P50207 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Hoxc13P50207 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Hoxc13P50207 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Hoxc13P50207 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Hoxc13P50207 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Hoxc13P50207 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Hoxc13P50207 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Hoxc13P50207 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Hoxc13P50207 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Hoxc13P50207 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Hoxc13P50207 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Hoxc13P50207 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Hoxc13P50207 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Hoxc13P50207 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Hoxc13P50207 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Hoxc13P50207 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Hoxc13P50207 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Hoxc13P50207 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Hoxc13P50207 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Hoxc13P50207 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Hoxc13P50207 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Hoxc13P50207 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Hoxc13P50207 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Hoxc13P50207 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Hoxc13P50207 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Hoxc13P50207 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Hoxc13P50207 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Hoxc13P50207 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Hoxc13P50207 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Hoxc13P50207 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Hoxc13P50207 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Hoxc13P50207 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Hoxc13P50207 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Hoxc13P50207 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Hoxc13P50207 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Hoxc13P50207 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Hoxc13P50207 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Hoxc13P50207 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Hoxc13P50207 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Hoxc13P50207 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Hoxc13P50207 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Hoxc13P50207 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Hoxc13P50207 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Hoxc13P50207 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Hoxc13P50207 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Hoxc13P50207 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Hoxc13P50207 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Hoxc13P50207 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Hoxc13P50207 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Hoxc13P50207 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Hoxc13P50207 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Hoxc13P50207 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Hoxc13P50207 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Hoxc13P50207 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Hoxc13P50207 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Hoxc13P50207 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Hoxc13P50207 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Hoxc13P50207 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Hoxc13P50207 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Hoxc13P50207 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hoxc13P50207 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hoxc13P50207 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Hoxc13P50207 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Hoxc13P50207 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Hoxc13P50207 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Hoxc13P50207 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Hoxc13P50207 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Hoxc13P50207 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Hoxc13P50207 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Hoxc13P50207 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Hoxc13P50207 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Hoxc13P50207 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Hoxc13P50207 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Hoxc13P50207 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Hoxc13P50207 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hoxc13P50207 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hoxc13P50207 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hoxc13P50207 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hoxc13P50207 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Hoxc13P50207 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Hoxc13P50207 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Hoxc13P50207 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Hoxc13P50207 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Hoxc13P50207 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Hoxc13P50207 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Hoxc13P50207 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms