Protein–RNA interactions for Protein: P48757

Gast, Gastrin, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GastP48757 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
GastP48757 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21,72■■□□□ 1,07
GastP48757 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21,72■■□□□ 1,07
GastP48757 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,71■■□□□ 1,07
GastP48757 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21,71■■□□□ 1,07
GastP48757 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,71■■□□□ 1,07
GastP48757 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21,7■■□□□ 1,06
GastP48757 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,69■■□□□ 1,06
GastP48757 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21,68■■□□□ 1,06
GastP48757 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,67■■□□□ 1,06
GastP48757 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21,67■■□□□ 1,06
GastP48757 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
GastP48757 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
GastP48757 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
GastP48757 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
GastP48757 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
GastP48757 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,06
GastP48757 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,06
GastP48757 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,05
GastP48757 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,63■■□□□ 1,05
GastP48757 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21,63■■□□□ 1,05
GastP48757 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21,62■■□□□ 1,05
GastP48757 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21,6■■□□□ 1,05
GastP48757 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,59■■□□□ 1,05
GastP48757 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21,58■■□□□ 1,05
GastP48757 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,57■■□□□ 1,04
GastP48757 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21,57■■□□□ 1,04
GastP48757 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21,57■■□□□ 1,04
GastP48757 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
GastP48757 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
GastP48757 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
GastP48757 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
GastP48757 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21,55■■□□□ 1,04
GastP48757 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
GastP48757 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,54■■□□□ 1,04
GastP48757 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,54■■□□□ 1,04
GastP48757 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,52■■□□□ 1,04
GastP48757 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,52■■□□□ 1,04
GastP48757 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21,51■■□□□ 1,03
GastP48757 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,5■■□□□ 1,03
GastP48757 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,5■■□□□ 1,03
GastP48757 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,5■■□□□ 1,03
GastP48757 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21,5■■□□□ 1,03
GastP48757 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,5■■□□□ 1,03
GastP48757 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21,49■■□□□ 1,03
GastP48757 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,49■■□□□ 1,03
GastP48757 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,48■■□□□ 1,03
GastP48757 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,48■■□□□ 1,03
GastP48757 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,47■■□□□ 1,03
GastP48757 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,47■■□□□ 1,03
GastP48757 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,47■■□□□ 1,03
GastP48757 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21,47■■□□□ 1,03
GastP48757 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21,46■■□□□ 1,03
GastP48757 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,46■■□□□ 1,03
GastP48757 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21,44■■□□□ 1,02
GastP48757 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,44■■□□□ 1,02
GastP48757 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,44■■□□□ 1,02
GastP48757 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
GastP48757 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21,43■■□□□ 1,02
GastP48757 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,41■■□□□ 1,02
GastP48757 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,41■■□□□ 1,02
GastP48757 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,41■■□□□ 1,02
GastP48757 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,4■■□□□ 1,02
GastP48757 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21,4■■□□□ 1,02
GastP48757 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21,4■■□□□ 1,02
GastP48757 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21,4■■□□□ 1,02
GastP48757 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,39■■□□□ 1,01
GastP48757 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,39■■□□□ 1,01
GastP48757 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,39■■□□□ 1,01
GastP48757 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,38■■□□□ 1,01
GastP48757 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,38■■□□□ 1,01
GastP48757 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21,38■■□□□ 1,01
GastP48757 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21,38■■□□□ 1,01
GastP48757 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,37■■□□□ 1,01
GastP48757 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,37■■□□□ 1,01
GastP48757 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,36■■□□□ 1,01
GastP48757 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
GastP48757 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
GastP48757 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
GastP48757 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
GastP48757 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
GastP48757 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
GastP48757 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
GastP48757 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21,35■■□□□ 1,01
GastP48757 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,35■■□□□ 1,01
GastP48757 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,34■■□□□ 1,01
GastP48757 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21,34■■□□□ 1,01
GastP48757 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21,33■■□□□ 1,01
GastP48757 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21,32■■□□□ 1
GastP48757 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,31■■□□□ 1
GastP48757 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,31■■□□□ 1
GastP48757 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21,31■■□□□ 1
GastP48757 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21,3■■□□□ 1
GastP48757 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21,3■■□□□ 1
GastP48757 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,3■■□□□ 1
GastP48757 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,3■■□□□ 1
GastP48757 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,3■■□□□ 1
GastP48757 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,3■■□□□ 1
GastP48757 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21,29■■□□□ 1
GastP48757 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21,29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,9 ms