Protein–RNA interactions for Protein: P47968

Rpia, Ribose-5-phosphate isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpiaP47968 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RpiaP47968 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RpiaP47968 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RpiaP47968 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RpiaP47968 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RpiaP47968 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RpiaP47968 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RpiaP47968 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RpiaP47968 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RpiaP47968 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RpiaP47968 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RpiaP47968 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RpiaP47968 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RpiaP47968 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RpiaP47968 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RpiaP47968 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RpiaP47968 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RpiaP47968 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RpiaP47968 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RpiaP47968 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RpiaP47968 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RpiaP47968 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RpiaP47968 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RpiaP47968 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RpiaP47968 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RpiaP47968 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RpiaP47968 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RpiaP47968 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RpiaP47968 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RpiaP47968 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RpiaP47968 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RpiaP47968 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RpiaP47968 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RpiaP47968 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RpiaP47968 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RpiaP47968 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RpiaP47968 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RpiaP47968 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RpiaP47968 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RpiaP47968 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RpiaP47968 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RpiaP47968 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RpiaP47968 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RpiaP47968 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RpiaP47968 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RpiaP47968 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RpiaP47968 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RpiaP47968 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RpiaP47968 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RpiaP47968 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RpiaP47968 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RpiaP47968 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RpiaP47968 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RpiaP47968 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RpiaP47968 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RpiaP47968 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RpiaP47968 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RpiaP47968 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RpiaP47968 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RpiaP47968 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RpiaP47968 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RpiaP47968 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RpiaP47968 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RpiaP47968 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RpiaP47968 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RpiaP47968 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RpiaP47968 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RpiaP47968 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RpiaP47968 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RpiaP47968 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RpiaP47968 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RpiaP47968 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RpiaP47968 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RpiaP47968 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RpiaP47968 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RpiaP47968 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RpiaP47968 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RpiaP47968 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RpiaP47968 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RpiaP47968 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RpiaP47968 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RpiaP47968 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RpiaP47968 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RpiaP47968 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RpiaP47968 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RpiaP47968 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RpiaP47968 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RpiaP47968 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RpiaP47968 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RpiaP47968 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RpiaP47968 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RpiaP47968 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RpiaP47968 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RpiaP47968 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RpiaP47968 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RpiaP47968 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RpiaP47968 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RpiaP47968 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RpiaP47968 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RpiaP47968 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms