Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gli1P47806 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gli1P47806 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gli1P47806 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gli1P47806 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gli1P47806 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gli1P47806 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gli1P47806 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gli1P47806 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gli1P47806 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gli1P47806 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gli1P47806 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gli1P47806 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gli1P47806 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gli1P47806 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gli1P47806 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gli1P47806 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gli1P47806 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gli1P47806 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gli1P47806 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gli1P47806 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gli1P47806 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gli1P47806 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gli1P47806 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gli1P47806 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gli1P47806 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gli1P47806 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gli1P47806 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gli1P47806 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Gli1P47806 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gli1P47806 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gli1P47806 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gli1P47806 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gli1P47806 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gli1P47806 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gli1P47806 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gli1P47806 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gli1P47806 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gli1P47806 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gli1P47806 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gli1P47806 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gli1P47806 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Gli1P47806 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gli1P47806 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gli1P47806 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gli1P47806 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gli1P47806 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gli1P47806 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gli1P47806 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gli1P47806 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gli1P47806 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gli1P47806 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gli1P47806 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gli1P47806 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gli1P47806 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gli1P47806 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gli1P47806 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gli1P47806 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gli1P47806 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gli1P47806 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gli1P47806 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gli1P47806 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gli1P47806 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gli1P47806 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gli1P47806 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gli1P47806 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gli1P47806 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gli1P47806 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gli1P47806 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gli1P47806 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gli1P47806 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gli1P47806 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gli1P47806 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gli1P47806 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gli1P47806 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gli1P47806 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gli1P47806 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gli1P47806 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gli1P47806 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Gli1P47806 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gli1P47806 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gli1P47806 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gli1P47806 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gli1P47806 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gli1P47806 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gli1P47806 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gli1P47806 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gli1P47806 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gli1P47806 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gli1P47806 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gli1P47806 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gli1P47806 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gli1P47806 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gli1P47806 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gli1P47806 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gli1P47806 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gli1P47806 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gli1P47806 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gli1P47806 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gli1P47806 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms