Protein–RNA interactions for Protein: P46660

Ina, Alpha-internexin, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InaP46660 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
InaP46660 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
InaP46660 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
InaP46660 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
InaP46660 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
InaP46660 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
InaP46660 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
InaP46660 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
InaP46660 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
InaP46660 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
InaP46660 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
InaP46660 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
InaP46660 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
InaP46660 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
InaP46660 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
InaP46660 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
InaP46660 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
InaP46660 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
InaP46660 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
InaP46660 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
InaP46660 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
InaP46660 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
InaP46660 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
InaP46660 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
InaP46660 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
InaP46660 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
InaP46660 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
InaP46660 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
InaP46660 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
InaP46660 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
InaP46660 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
InaP46660 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
InaP46660 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
InaP46660 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
InaP46660 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
InaP46660 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
InaP46660 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
InaP46660 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
InaP46660 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
InaP46660 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
InaP46660 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
InaP46660 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
InaP46660 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
InaP46660 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
InaP46660 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
InaP46660 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
InaP46660 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
InaP46660 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
InaP46660 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
InaP46660 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
InaP46660 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
InaP46660 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
InaP46660 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
InaP46660 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
InaP46660 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
InaP46660 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
InaP46660 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
InaP46660 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
InaP46660 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
InaP46660 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
InaP46660 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
InaP46660 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
InaP46660 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
InaP46660 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
InaP46660 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
InaP46660 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
InaP46660 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
InaP46660 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
InaP46660 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
InaP46660 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
InaP46660 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
InaP46660 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
InaP46660 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
InaP46660 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
InaP46660 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
InaP46660 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
InaP46660 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
InaP46660 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
InaP46660 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
InaP46660 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
InaP46660 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
InaP46660 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
InaP46660 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
InaP46660 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
InaP46660 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
InaP46660 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
InaP46660 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
InaP46660 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
InaP46660 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
InaP46660 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
InaP46660 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
InaP46660 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
InaP46660 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
InaP46660 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
InaP46660 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
InaP46660 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
InaP46660 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
InaP46660 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
InaP46660 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
InaP46660 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms