Protein–RNA interactions for Protein: P39061

Col18a1, Collagen alpha-1(XVIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col18a1P39061 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Col18a1P39061 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Col18a1P39061 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.22
Col18a1P39061 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Col18a1P39061 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Col18a1P39061 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Col18a1P39061 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Col18a1P39061 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Col18a1P39061 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Col18a1P39061 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Col18a1P39061 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Col18a1P39061 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Col18a1P39061 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Col18a1P39061 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Col18a1P39061 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Col18a1P39061 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Col18a1P39061 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
Col18a1P39061 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Col18a1P39061 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Col18a1P39061 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Col18a1P39061 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Col18a1P39061 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
Col18a1P39061 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Col18a1P39061 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Col18a1P39061 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Col18a1P39061 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Col18a1P39061 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Col18a1P39061 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Col18a1P39061 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Col18a1P39061 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Col18a1P39061 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Col18a1P39061 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Col18a1P39061 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Col18a1P39061 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Col18a1P39061 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Col18a1P39061 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Col18a1P39061 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Col18a1P39061 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Col18a1P39061 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Col18a1P39061 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Col18a1P39061 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Col18a1P39061 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Col18a1P39061 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Col18a1P39061 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Col18a1P39061 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Col18a1P39061 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC34.82■■■■□ 3.17
Col18a1P39061 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
Col18a1P39061 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Col18a1P39061 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Col18a1P39061 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Col18a1P39061 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Col18a1P39061 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Col18a1P39061 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Col18a1P39061 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Col18a1P39061 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Col18a1P39061 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.76■■■■□ 3.15
Col18a1P39061 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Col18a1P39061 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Col18a1P39061 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Col18a1P39061 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Col18a1P39061 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Col18a1P39061 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Col18a1P39061 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Col18a1P39061 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Col18a1P39061 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Col18a1P39061 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Col18a1P39061 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Col18a1P39061 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
Col18a1P39061 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Col18a1P39061 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Col18a1P39061 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Col18a1P39061 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Col18a1P39061 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Col18a1P39061 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Col18a1P39061 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Col18a1P39061 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Col18a1P39061 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Col18a1P39061 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Col18a1P39061 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Col18a1P39061 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Col18a1P39061 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Col18a1P39061 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Col18a1P39061 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Col18a1P39061 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Col18a1P39061 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Col18a1P39061 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Col18a1P39061 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
Col18a1P39061 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Col18a1P39061 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Col18a1P39061 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Col18a1P39061 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Col18a1P39061 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Col18a1P39061 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Col18a1P39061 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Col18a1P39061 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Col18a1P39061 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Col18a1P39061 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Col18a1P39061 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Col18a1P39061 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Col18a1P39061 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms