Protein–RNA interactions for Protein: P35710

Sox5, Transcription factor SOX-5, mousemouse

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox5P35710 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sox5P35710 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sox5P35710 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sox5P35710 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sox5P35710 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sox5P35710 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sox5P35710 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sox5P35710 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Sox5P35710 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sox5P35710 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sox5P35710 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sox5P35710 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sox5P35710 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sox5P35710 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sox5P35710 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Sox5P35710 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Sox5P35710 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sox5P35710 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sox5P35710 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sox5P35710 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sox5P35710 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sox5P35710 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sox5P35710 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sox5P35710 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sox5P35710 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sox5P35710 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Sox5P35710 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sox5P35710 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sox5P35710 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sox5P35710 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sox5P35710 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sox5P35710 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sox5P35710 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Sox5P35710 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Sox5P35710 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sox5P35710 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sox5P35710 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sox5P35710 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sox5P35710 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sox5P35710 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sox5P35710 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sox5P35710 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sox5P35710 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sox5P35710 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sox5P35710 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sox5P35710 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sox5P35710 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sox5P35710 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sox5P35710 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sox5P35710 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Sox5P35710 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Sox5P35710 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Sox5P35710 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sox5P35710 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sox5P35710 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sox5P35710 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sox5P35710 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sox5P35710 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sox5P35710 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sox5P35710 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sox5P35710 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sox5P35710 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sox5P35710 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Sox5P35710 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sox5P35710 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sox5P35710 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sox5P35710 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sox5P35710 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sox5P35710 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sox5P35710 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sox5P35710 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sox5P35710 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sox5P35710 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sox5P35710 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sox5P35710 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sox5P35710 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sox5P35710 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sox5P35710 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sox5P35710 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sox5P35710 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sox5P35710 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Sox5P35710 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sox5P35710 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sox5P35710 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sox5P35710 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sox5P35710 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sox5P35710 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sox5P35710 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sox5P35710 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sox5P35710 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Sox5P35710 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sox5P35710 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sox5P35710 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sox5P35710 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sox5P35710 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sox5P35710 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sox5P35710 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sox5P35710 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Sox5P35710 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sox5P35710 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms