Protein–RNA interactions for Protein: P35486

Pdha1, Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit alpha, somatic form, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdha1P35486 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pdha1P35486 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pdha1P35486 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pdha1P35486 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pdha1P35486 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pdha1P35486 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Pdha1P35486 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pdha1P35486 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pdha1P35486 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Pdha1P35486 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pdha1P35486 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pdha1P35486 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pdha1P35486 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pdha1P35486 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pdha1P35486 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pdha1P35486 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pdha1P35486 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pdha1P35486 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Pdha1P35486 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pdha1P35486 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pdha1P35486 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pdha1P35486 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pdha1P35486 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pdha1P35486 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pdha1P35486 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pdha1P35486 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pdha1P35486 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pdha1P35486 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pdha1P35486 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pdha1P35486 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pdha1P35486 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pdha1P35486 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pdha1P35486 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pdha1P35486 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pdha1P35486 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pdha1P35486 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pdha1P35486 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pdha1P35486 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Pdha1P35486 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pdha1P35486 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pdha1P35486 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pdha1P35486 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pdha1P35486 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pdha1P35486 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pdha1P35486 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Pdha1P35486 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pdha1P35486 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pdha1P35486 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pdha1P35486 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pdha1P35486 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pdha1P35486 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pdha1P35486 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pdha1P35486 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pdha1P35486 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pdha1P35486 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Pdha1P35486 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Pdha1P35486 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pdha1P35486 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pdha1P35486 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pdha1P35486 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pdha1P35486 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pdha1P35486 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pdha1P35486 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pdha1P35486 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pdha1P35486 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pdha1P35486 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pdha1P35486 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pdha1P35486 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pdha1P35486 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pdha1P35486 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pdha1P35486 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pdha1P35486 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pdha1P35486 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pdha1P35486 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pdha1P35486 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pdha1P35486 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pdha1P35486 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pdha1P35486 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pdha1P35486 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pdha1P35486 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pdha1P35486 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pdha1P35486 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pdha1P35486 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Pdha1P35486 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Pdha1P35486 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Pdha1P35486 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pdha1P35486 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pdha1P35486 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pdha1P35486 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pdha1P35486 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pdha1P35486 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pdha1P35486 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pdha1P35486 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pdha1P35486 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Pdha1P35486 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pdha1P35486 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pdha1P35486 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pdha1P35486 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pdha1P35486 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pdha1P35486 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms