Protein–RNA interactions for Protein: P33896

Ifnar1, Interferon alpha/beta receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnar1P33896 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ifnar1P33896 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ifnar1P33896 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ifnar1P33896 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Ifnar1P33896 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ifnar1P33896 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ifnar1P33896 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Ifnar1P33896 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ifnar1P33896 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Ifnar1P33896 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ifnar1P33896 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ifnar1P33896 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ifnar1P33896 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ifnar1P33896 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Ifnar1P33896 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ifnar1P33896 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ifnar1P33896 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ifnar1P33896 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ifnar1P33896 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ifnar1P33896 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ifnar1P33896 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ifnar1P33896 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ifnar1P33896 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ifnar1P33896 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ifnar1P33896 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ifnar1P33896 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Ifnar1P33896 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ifnar1P33896 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ifnar1P33896 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ifnar1P33896 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ifnar1P33896 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ifnar1P33896 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ifnar1P33896 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ifnar1P33896 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ifnar1P33896 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ifnar1P33896 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ifnar1P33896 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Ifnar1P33896 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ifnar1P33896 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ifnar1P33896 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ifnar1P33896 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ifnar1P33896 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ifnar1P33896 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ifnar1P33896 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ifnar1P33896 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ifnar1P33896 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ifnar1P33896 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ifnar1P33896 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ifnar1P33896 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Ifnar1P33896 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ifnar1P33896 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ifnar1P33896 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ifnar1P33896 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ifnar1P33896 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ifnar1P33896 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ifnar1P33896 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ifnar1P33896 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ifnar1P33896 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ifnar1P33896 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ifnar1P33896 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ifnar1P33896 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ifnar1P33896 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ifnar1P33896 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Ifnar1P33896 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ifnar1P33896 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ifnar1P33896 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ifnar1P33896 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ifnar1P33896 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ifnar1P33896 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ifnar1P33896 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ifnar1P33896 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ifnar1P33896 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ifnar1P33896 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ifnar1P33896 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ifnar1P33896 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ifnar1P33896 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Ifnar1P33896 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ifnar1P33896 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ifnar1P33896 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ifnar1P33896 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ifnar1P33896 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ifnar1P33896 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ifnar1P33896 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ifnar1P33896 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ifnar1P33896 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ifnar1P33896 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Ifnar1P33896 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ifnar1P33896 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ifnar1P33896 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ifnar1P33896 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ifnar1P33896 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ifnar1P33896 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ifnar1P33896 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ifnar1P33896 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ifnar1P33896 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ifnar1P33896 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ifnar1P33896 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ifnar1P33896 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ifnar1P33896 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ifnar1P33896 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms