Protein–RNA interactions for Protein: P29416

Hexa, Beta-hexosaminidase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HexaP29416 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HexaP29416 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HexaP29416 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HexaP29416 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HexaP29416 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HexaP29416 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HexaP29416 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HexaP29416 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HexaP29416 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HexaP29416 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HexaP29416 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HexaP29416 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
HexaP29416 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HexaP29416 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HexaP29416 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HexaP29416 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HexaP29416 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
HexaP29416 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HexaP29416 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HexaP29416 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HexaP29416 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HexaP29416 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HexaP29416 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HexaP29416 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HexaP29416 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HexaP29416 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HexaP29416 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HexaP29416 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HexaP29416 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HexaP29416 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HexaP29416 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HexaP29416 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HexaP29416 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HexaP29416 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HexaP29416 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HexaP29416 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HexaP29416 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HexaP29416 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HexaP29416 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HexaP29416 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HexaP29416 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HexaP29416 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HexaP29416 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HexaP29416 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HexaP29416 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HexaP29416 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HexaP29416 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HexaP29416 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HexaP29416 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HexaP29416 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HexaP29416 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HexaP29416 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HexaP29416 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HexaP29416 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HexaP29416 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HexaP29416 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HexaP29416 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HexaP29416 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
HexaP29416 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HexaP29416 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HexaP29416 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HexaP29416 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HexaP29416 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HexaP29416 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HexaP29416 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HexaP29416 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HexaP29416 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HexaP29416 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HexaP29416 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HexaP29416 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HexaP29416 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HexaP29416 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HexaP29416 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HexaP29416 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HexaP29416 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HexaP29416 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HexaP29416 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HexaP29416 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HexaP29416 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HexaP29416 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HexaP29416 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HexaP29416 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HexaP29416 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HexaP29416 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HexaP29416 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HexaP29416 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HexaP29416 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HexaP29416 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HexaP29416 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HexaP29416 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HexaP29416 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HexaP29416 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HexaP29416 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HexaP29416 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HexaP29416 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HexaP29416 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HexaP29416 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HexaP29416 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HexaP29416 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HexaP29416 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms