Protein–RNA interactions for Protein: P28667

Marcksl1, MARCKS-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Marcksl1P28667 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Marcksl1P28667 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Marcksl1P28667 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Marcksl1P28667 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Marcksl1P28667 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Marcksl1P28667 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Marcksl1P28667 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Marcksl1P28667 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Marcksl1P28667 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Marcksl1P28667 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Marcksl1P28667 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Marcksl1P28667 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Marcksl1P28667 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Marcksl1P28667 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Marcksl1P28667 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Marcksl1P28667 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Marcksl1P28667 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Marcksl1P28667 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Marcksl1P28667 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Marcksl1P28667 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Marcksl1P28667 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Marcksl1P28667 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Marcksl1P28667 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Marcksl1P28667 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Marcksl1P28667 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Marcksl1P28667 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Marcksl1P28667 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Marcksl1P28667 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Marcksl1P28667 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Marcksl1P28667 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Marcksl1P28667 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Marcksl1P28667 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Marcksl1P28667 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Marcksl1P28667 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Marcksl1P28667 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Marcksl1P28667 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Marcksl1P28667 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Marcksl1P28667 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Marcksl1P28667 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Marcksl1P28667 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Marcksl1P28667 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Marcksl1P28667 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Marcksl1P28667 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Marcksl1P28667 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Marcksl1P28667 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Marcksl1P28667 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Marcksl1P28667 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Marcksl1P28667 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Marcksl1P28667 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Marcksl1P28667 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Marcksl1P28667 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Marcksl1P28667 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Marcksl1P28667 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Marcksl1P28667 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Marcksl1P28667 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Marcksl1P28667 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Marcksl1P28667 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Marcksl1P28667 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Marcksl1P28667 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Marcksl1P28667 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Marcksl1P28667 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Marcksl1P28667 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Marcksl1P28667 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Marcksl1P28667 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Marcksl1P28667 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Marcksl1P28667 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Marcksl1P28667 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Marcksl1P28667 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Marcksl1P28667 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Marcksl1P28667 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Marcksl1P28667 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Marcksl1P28667 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Marcksl1P28667 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Marcksl1P28667 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Marcksl1P28667 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Marcksl1P28667 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Marcksl1P28667 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Marcksl1P28667 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Marcksl1P28667 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Marcksl1P28667 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Marcksl1P28667 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Marcksl1P28667 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Marcksl1P28667 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Marcksl1P28667 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Marcksl1P28667 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Marcksl1P28667 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Marcksl1P28667 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Marcksl1P28667 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Marcksl1P28667 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Marcksl1P28667 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Marcksl1P28667 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Marcksl1P28667 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Marcksl1P28667 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Marcksl1P28667 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Marcksl1P28667 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Marcksl1P28667 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Marcksl1P28667 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Marcksl1P28667 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Marcksl1P28667 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Marcksl1P28667 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 210.5 ms