Protein–RNA interactions for Protein: P28658

Atxn10, Ataxin-10, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn10P28658 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atxn10P28658 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atxn10P28658 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atxn10P28658 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atxn10P28658 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atxn10P28658 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atxn10P28658 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atxn10P28658 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atxn10P28658 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atxn10P28658 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atxn10P28658 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atxn10P28658 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atxn10P28658 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atxn10P28658 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atxn10P28658 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atxn10P28658 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atxn10P28658 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atxn10P28658 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atxn10P28658 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Atxn10P28658 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Atxn10P28658 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atxn10P28658 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atxn10P28658 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atxn10P28658 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atxn10P28658 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atxn10P28658 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atxn10P28658 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atxn10P28658 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atxn10P28658 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atxn10P28658 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atxn10P28658 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atxn10P28658 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atxn10P28658 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atxn10P28658 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atxn10P28658 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atxn10P28658 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atxn10P28658 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Atxn10P28658 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atxn10P28658 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atxn10P28658 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atxn10P28658 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atxn10P28658 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atxn10P28658 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atxn10P28658 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atxn10P28658 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Atxn10P28658 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atxn10P28658 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atxn10P28658 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atxn10P28658 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atxn10P28658 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atxn10P28658 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atxn10P28658 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atxn10P28658 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atxn10P28658 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atxn10P28658 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atxn10P28658 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atxn10P28658 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atxn10P28658 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atxn10P28658 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atxn10P28658 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atxn10P28658 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atxn10P28658 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atxn10P28658 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atxn10P28658 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atxn10P28658 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atxn10P28658 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Atxn10P28658 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Atxn10P28658 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Atxn10P28658 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Atxn10P28658 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atxn10P28658 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atxn10P28658 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atxn10P28658 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atxn10P28658 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atxn10P28658 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atxn10P28658 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atxn10P28658 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atxn10P28658 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atxn10P28658 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atxn10P28658 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Atxn10P28658 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atxn10P28658 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atxn10P28658 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atxn10P28658 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atxn10P28658 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atxn10P28658 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atxn10P28658 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atxn10P28658 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Atxn10P28658 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atxn10P28658 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atxn10P28658 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atxn10P28658 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atxn10P28658 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atxn10P28658 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atxn10P28658 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atxn10P28658 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atxn10P28658 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atxn10P28658 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atxn10P28658 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Atxn10P28658 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms