Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hoxd9P28357 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxd9P28357 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxd9P28357 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxd9P28357 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxd9P28357 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxd9P28357 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxd9P28357 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxd9P28357 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxd9P28357 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxd9P28357 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxd9P28357 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxd9P28357 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxd9P28357 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxd9P28357 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hoxd9P28357 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxd9P28357 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxd9P28357 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxd9P28357 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxd9P28357 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxd9P28357 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxd9P28357 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxd9P28357 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxd9P28357 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxd9P28357 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxd9P28357 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxd9P28357 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxd9P28357 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxd9P28357 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxd9P28357 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxd9P28357 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxd9P28357 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxd9P28357 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxd9P28357 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxd9P28357 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxd9P28357 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxd9P28357 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxd9P28357 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxd9P28357 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxd9P28357 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxd9P28357 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxd9P28357 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxd9P28357 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxd9P28357 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxd9P28357 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxd9P28357 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxd9P28357 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxd9P28357 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxd9P28357 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxd9P28357 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxd9P28357 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxd9P28357 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxd9P28357 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxd9P28357 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxd9P28357 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxd9P28357 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxd9P28357 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxd9P28357 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxd9P28357 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxd9P28357 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hoxd9P28357 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hoxd9P28357 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hoxd9P28357 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxd9P28357 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxd9P28357 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxd9P28357 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxd9P28357 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxd9P28357 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxd9P28357 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxd9P28357 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxd9P28357 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hoxd9P28357 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxd9P28357 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxd9P28357 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxd9P28357 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxd9P28357 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxd9P28357 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxd9P28357 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxd9P28357 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxd9P28357 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxd9P28357 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxd9P28357 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxd9P28357 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxd9P28357 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxd9P28357 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxd9P28357 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxd9P28357 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxd9P28357 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxd9P28357 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxd9P28357 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxd9P28357 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxd9P28357 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxd9P28357 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxd9P28357 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxd9P28357 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxd9P28357 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxd9P28357 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxd9P28357 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxd9P28357 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxd9P28357 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms