Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Defa5P28312 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Defa5P28312 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Defa5P28312 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Defa5P28312 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Defa5P28312 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Defa5P28312 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Defa5P28312 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa5P28312 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa5P28312 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa5P28312 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa5P28312 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Defa5P28312 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Defa5P28312 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Defa5P28312 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Defa5P28312 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Defa5P28312 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa5P28312 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa5P28312 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa5P28312 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Defa5P28312 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Defa5P28312 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Defa5P28312 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Defa5P28312 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defa5P28312 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defa5P28312 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defa5P28312 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Defa5P28312 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defa5P28312 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defa5P28312 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defa5P28312 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Defa5P28312 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Defa5P28312 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Defa5P28312 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Defa5P28312 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Defa5P28312 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Defa5P28312 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Defa5P28312 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Defa5P28312 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Defa5P28312 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Defa5P28312 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Defa5P28312 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Defa5P28312 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Defa5P28312 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Defa5P28312 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Defa5P28312 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Defa5P28312 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Defa5P28312 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Defa5P28312 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Defa5P28312 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Defa5P28312 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Defa5P28312 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Defa5P28312 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Defa5P28312 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Defa5P28312 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Defa5P28312 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Defa5P28312 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Defa5P28312 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Defa5P28312 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Defa5P28312 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Defa5P28312 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Defa5P28312 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Defa5P28312 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Defa5P28312 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa5P28312 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa5P28312 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa5P28312 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa5P28312 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa5P28312 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Defa5P28312 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Defa5P28312 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Defa5P28312 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Defa5P28312 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa5P28312 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa5P28312 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa5P28312 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Defa5P28312 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Defa5P28312 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Defa5P28312 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Defa5P28312 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Defa5P28312 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Defa5P28312 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Defa5P28312 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Defa5P28312 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Defa5P28312 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Defa5P28312 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Defa5P28312 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Defa5P28312 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Defa5P28312 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Defa5P28312 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Defa5P28312 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa5P28312 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa5P28312 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa5P28312 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa5P28312 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa5P28312 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Defa5P28312 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Defa5P28312 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Defa5P28312 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Defa5P28312 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms