Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,5■□□□□ 0,39
Defa3P28310 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,5■□□□□ 0,39
Defa3P28310 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,5■□□□□ 0,39
Defa3P28310 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,5■□□□□ 0,39
Defa3P28310 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,5■□□□□ 0,39
Defa3P28310 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,5■□□□□ 0,39
Defa3P28310 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17,5■□□□□ 0,39
Defa3P28310 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,49■□□□□ 0,39
Defa3P28310 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,49■□□□□ 0,39
Defa3P28310 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,49■□□□□ 0,39
Defa3P28310 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,48■□□□□ 0,39
Defa3P28310 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC17,48■□□□□ 0,39
Defa3P28310 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,48■□□□□ 0,39
Defa3P28310 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17,48■□□□□ 0,39
Defa3P28310 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,48■□□□□ 0,39
Defa3P28310 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,47■□□□□ 0,39
Defa3P28310 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17,47■□□□□ 0,39
Defa3P28310 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,47■□□□□ 0,39
Defa3P28310 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,46■□□□□ 0,39
Defa3P28310 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,46■□□□□ 0,39
Defa3P28310 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,46■□□□□ 0,39
Defa3P28310 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,46■□□□□ 0,38
Defa3P28310 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,45■□□□□ 0,38
Defa3P28310 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC17,45■□□□□ 0,38
Defa3P28310 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,44■□□□□ 0,38
Defa3P28310 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17,44■□□□□ 0,38
Defa3P28310 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,44■□□□□ 0,38
Defa3P28310 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17,44■□□□□ 0,38
Defa3P28310 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,44■□□□□ 0,38
Defa3P28310 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17,43■□□□□ 0,38
Defa3P28310 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17,43■□□□□ 0,38
Defa3P28310 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,42■□□□□ 0,38
Defa3P28310 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,42■□□□□ 0,38
Defa3P28310 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,42■□□□□ 0,38
Defa3P28310 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,41■□□□□ 0,38
Defa3P28310 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17,41■□□□□ 0,38
Defa3P28310 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC17,41■□□□□ 0,38
Defa3P28310 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC17,4■□□□□ 0,38
Defa3P28310 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,4■□□□□ 0,38
Defa3P28310 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,39■□□□□ 0,38
Defa3P28310 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,39■□□□□ 0,38
Defa3P28310 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17,39■□□□□ 0,37
Defa3P28310 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,39■□□□□ 0,37
Defa3P28310 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,38■□□□□ 0,37
Defa3P28310 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17,38■□□□□ 0,37
Defa3P28310 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,38■□□□□ 0,37
Defa3P28310 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC17,37■□□□□ 0,37
Defa3P28310 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,36■□□□□ 0,37
Defa3P28310 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC17,36■□□□□ 0,37
Defa3P28310 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC17,36■□□□□ 0,37
Defa3P28310 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17,36■□□□□ 0,37
Defa3P28310 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,36■□□□□ 0,37
Defa3P28310 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,35■□□□□ 0,37
Defa3P28310 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17,35■□□□□ 0,37
Defa3P28310 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,35■□□□□ 0,37
Defa3P28310 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17,35■□□□□ 0,37
Defa3P28310 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,35■□□□□ 0,37
Defa3P28310 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,34■□□□□ 0,37
Defa3P28310 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17,33■□□□□ 0,37
Defa3P28310 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17,33■□□□□ 0,36
Defa3P28310 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC17,33■□□□□ 0,36
Defa3P28310 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17,33■□□□□ 0,36
Defa3P28310 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17,32■□□□□ 0,36
Defa3P28310 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17,32■□□□□ 0,36
Defa3P28310 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC17,32■□□□□ 0,36
Defa3P28310 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17,31■□□□□ 0,36
Defa3P28310 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,31■□□□□ 0,36
Defa3P28310 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,31■□□□□ 0,36
Defa3P28310 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,3■□□□□ 0,36
Defa3P28310 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,3■□□□□ 0,36
Defa3P28310 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,29■□□□□ 0,36
Defa3P28310 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,29■□□□□ 0,36
Defa3P28310 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC17,28■□□□□ 0,36
Defa3P28310 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC17,28■□□□□ 0,36
Defa3P28310 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,27■□□□□ 0,36
Defa3P28310 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,27■□□□□ 0,36
Defa3P28310 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,27■□□□□ 0,35
Defa3P28310 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC17,26■□□□□ 0,35
Defa3P28310 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,26■□□□□ 0,35
Defa3P28310 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17,26■□□□□ 0,35
Defa3P28310 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,25■□□□□ 0,35
Defa3P28310 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,25■□□□□ 0,35
Defa3P28310 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,24■□□□□ 0,35
Defa3P28310 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC17,23■□□□□ 0,35
Defa3P28310 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,23■□□□□ 0,35
Defa3P28310 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,23■□□□□ 0,35
Defa3P28310 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17,23■□□□□ 0,35
Defa3P28310 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC17,23■□□□□ 0,35
Defa3P28310 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17,23■□□□□ 0,35
Defa3P28310 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC17,23■□□□□ 0,35
Defa3P28310 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,23■□□□□ 0,35
Defa3P28310 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,22■□□□□ 0,35
Defa3P28310 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17,22■□□□□ 0,35
Defa3P28310 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,22■□□□□ 0,35
Defa3P28310 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,21■□□□□ 0,35
Defa3P28310 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17,21■□□□□ 0,35
Defa3P28310 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,21■□□□□ 0,35
Defa3P28310 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17,21■□□□□ 0,35
Defa3P28310 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,2■□□□□ 0,34
Defa3P28310 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,2■□□□□ 0,34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,2 ms