Protein–RNA interactions for Protein: P28236

Gja8, Gap junction alpha-8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja8P28236 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gja8P28236 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gja8P28236 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gja8P28236 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gja8P28236 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Gja8P28236 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gja8P28236 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gja8P28236 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gja8P28236 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gja8P28236 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gja8P28236 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gja8P28236 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gja8P28236 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Gja8P28236 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gja8P28236 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gja8P28236 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gja8P28236 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gja8P28236 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Gja8P28236 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gja8P28236 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gja8P28236 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gja8P28236 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gja8P28236 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gja8P28236 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gja8P28236 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gja8P28236 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gja8P28236 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gja8P28236 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gja8P28236 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gja8P28236 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gja8P28236 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gja8P28236 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gja8P28236 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gja8P28236 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gja8P28236 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gja8P28236 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gja8P28236 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gja8P28236 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gja8P28236 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gja8P28236 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gja8P28236 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gja8P28236 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gja8P28236 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gja8P28236 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gja8P28236 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gja8P28236 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gja8P28236 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gja8P28236 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gja8P28236 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gja8P28236 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gja8P28236 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gja8P28236 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gja8P28236 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gja8P28236 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gja8P28236 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gja8P28236 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gja8P28236 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gja8P28236 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gja8P28236 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gja8P28236 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gja8P28236 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gja8P28236 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gja8P28236 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gja8P28236 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gja8P28236 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gja8P28236 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gja8P28236 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gja8P28236 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gja8P28236 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gja8P28236 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gja8P28236 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gja8P28236 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gja8P28236 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gja8P28236 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gja8P28236 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gja8P28236 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gja8P28236 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gja8P28236 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gja8P28236 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gja8P28236 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gja8P28236 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gja8P28236 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gja8P28236 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gja8P28236 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Gja8P28236 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gja8P28236 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Gja8P28236 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Gja8P28236 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gja8P28236 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gja8P28236 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gja8P28236 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gja8P28236 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gja8P28236 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Gja8P28236 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gja8P28236 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gja8P28236 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Gja8P28236 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gja8P28236 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gja8P28236 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gja8P28236 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.4 ms