Protein–RNA interactions for Protein: P28028

Braf, Serine/threonine-protein kinase B-raf, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrafP28028 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BrafP28028 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BrafP28028 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BrafP28028 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BrafP28028 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
BrafP28028 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BrafP28028 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BrafP28028 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BrafP28028 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
BrafP28028 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BrafP28028 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BrafP28028 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BrafP28028 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BrafP28028 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BrafP28028 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BrafP28028 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BrafP28028 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BrafP28028 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BrafP28028 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BrafP28028 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
BrafP28028 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BrafP28028 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BrafP28028 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BrafP28028 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BrafP28028 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BrafP28028 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BrafP28028 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BrafP28028 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BrafP28028 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BrafP28028 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BrafP28028 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BrafP28028 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BrafP28028 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BrafP28028 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BrafP28028 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BrafP28028 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BrafP28028 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BrafP28028 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BrafP28028 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BrafP28028 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BrafP28028 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BrafP28028 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BrafP28028 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
BrafP28028 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BrafP28028 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BrafP28028 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BrafP28028 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BrafP28028 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BrafP28028 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BrafP28028 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BrafP28028 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BrafP28028 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BrafP28028 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BrafP28028 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BrafP28028 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BrafP28028 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BrafP28028 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BrafP28028 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BrafP28028 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
BrafP28028 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BrafP28028 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BrafP28028 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BrafP28028 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BrafP28028 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
BrafP28028 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BrafP28028 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BrafP28028 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BrafP28028 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BrafP28028 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BrafP28028 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BrafP28028 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BrafP28028 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BrafP28028 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BrafP28028 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BrafP28028 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BrafP28028 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BrafP28028 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BrafP28028 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BrafP28028 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BrafP28028 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BrafP28028 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BrafP28028 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BrafP28028 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BrafP28028 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BrafP28028 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BrafP28028 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BrafP28028 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BrafP28028 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BrafP28028 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BrafP28028 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
BrafP28028 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BrafP28028 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BrafP28028 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BrafP28028 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BrafP28028 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BrafP28028 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BrafP28028 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BrafP28028 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
BrafP28028 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BrafP28028 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms