Protein–RNA interactions for Protein: P26516

Psmd7, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd7P26516 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psmd7P26516 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psmd7P26516 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psmd7P26516 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psmd7P26516 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psmd7P26516 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psmd7P26516 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Psmd7P26516 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Psmd7P26516 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Psmd7P26516 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Psmd7P26516 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psmd7P26516 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psmd7P26516 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psmd7P26516 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psmd7P26516 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psmd7P26516 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psmd7P26516 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psmd7P26516 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psmd7P26516 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psmd7P26516 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psmd7P26516 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Psmd7P26516 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Psmd7P26516 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Psmd7P26516 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Psmd7P26516 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Psmd7P26516 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psmd7P26516 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psmd7P26516 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psmd7P26516 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psmd7P26516 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psmd7P26516 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psmd7P26516 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psmd7P26516 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psmd7P26516 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psmd7P26516 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psmd7P26516 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Psmd7P26516 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Psmd7P26516 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psmd7P26516 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psmd7P26516 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Psmd7P26516 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psmd7P26516 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psmd7P26516 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Psmd7P26516 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psmd7P26516 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psmd7P26516 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psmd7P26516 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psmd7P26516 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Psmd7P26516 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psmd7P26516 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psmd7P26516 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psmd7P26516 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psmd7P26516 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psmd7P26516 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psmd7P26516 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psmd7P26516 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psmd7P26516 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psmd7P26516 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psmd7P26516 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psmd7P26516 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Psmd7P26516 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psmd7P26516 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Psmd7P26516 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psmd7P26516 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psmd7P26516 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psmd7P26516 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psmd7P26516 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psmd7P26516 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psmd7P26516 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psmd7P26516 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psmd7P26516 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psmd7P26516 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psmd7P26516 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psmd7P26516 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psmd7P26516 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psmd7P26516 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psmd7P26516 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psmd7P26516 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psmd7P26516 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psmd7P26516 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psmd7P26516 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Psmd7P26516 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psmd7P26516 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psmd7P26516 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psmd7P26516 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psmd7P26516 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Psmd7P26516 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psmd7P26516 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psmd7P26516 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psmd7P26516 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psmd7P26516 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psmd7P26516 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psmd7P26516 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psmd7P26516 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psmd7P26516 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psmd7P26516 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Psmd7P26516 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Psmd7P26516 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Psmd7P26516 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Psmd7P26516 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms