Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
ChgaP26339 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
ChgaP26339 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ChgaP26339 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ChgaP26339 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ChgaP26339 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ChgaP26339 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ChgaP26339 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ChgaP26339 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ChgaP26339 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ChgaP26339 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ChgaP26339 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ChgaP26339 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ChgaP26339 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ChgaP26339 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ChgaP26339 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ChgaP26339 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ChgaP26339 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
ChgaP26339 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
ChgaP26339 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ChgaP26339 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ChgaP26339 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ChgaP26339 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ChgaP26339 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ChgaP26339 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ChgaP26339 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ChgaP26339 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ChgaP26339 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ChgaP26339 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ChgaP26339 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
ChgaP26339 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ChgaP26339 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ChgaP26339 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
ChgaP26339 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ChgaP26339 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ChgaP26339 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ChgaP26339 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ChgaP26339 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ChgaP26339 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ChgaP26339 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ChgaP26339 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ChgaP26339 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ChgaP26339 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ChgaP26339 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ChgaP26339 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ChgaP26339 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ChgaP26339 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ChgaP26339 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ChgaP26339 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ChgaP26339 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ChgaP26339 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ChgaP26339 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ChgaP26339 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ChgaP26339 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ChgaP26339 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ChgaP26339 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ChgaP26339 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ChgaP26339 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ChgaP26339 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ChgaP26339 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
ChgaP26339 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
ChgaP26339 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ChgaP26339 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ChgaP26339 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
ChgaP26339 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
ChgaP26339 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ChgaP26339 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ChgaP26339 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ChgaP26339 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ChgaP26339 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ChgaP26339 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ChgaP26339 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ChgaP26339 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ChgaP26339 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ChgaP26339 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ChgaP26339 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ChgaP26339 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ChgaP26339 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ChgaP26339 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ChgaP26339 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ChgaP26339 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ChgaP26339 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ChgaP26339 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
ChgaP26339 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ChgaP26339 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ChgaP26339 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ChgaP26339 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ChgaP26339 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
ChgaP26339 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ChgaP26339 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ChgaP26339 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ChgaP26339 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ChgaP26339 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ChgaP26339 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ChgaP26339 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ChgaP26339 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ChgaP26339 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ChgaP26339 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ChgaP26339 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
ChgaP26339 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms