Protein–RNA interactions for Protein: P23708

Nfya, Nuclear transcription factor Y subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfyaP23708 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NfyaP23708 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NfyaP23708 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NfyaP23708 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NfyaP23708 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NfyaP23708 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NfyaP23708 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NfyaP23708 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NfyaP23708 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NfyaP23708 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NfyaP23708 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NfyaP23708 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NfyaP23708 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NfyaP23708 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NfyaP23708 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NfyaP23708 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
NfyaP23708 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NfyaP23708 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NfyaP23708 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NfyaP23708 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NfyaP23708 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NfyaP23708 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NfyaP23708 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NfyaP23708 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NfyaP23708 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NfyaP23708 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NfyaP23708 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NfyaP23708 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NfyaP23708 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NfyaP23708 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NfyaP23708 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NfyaP23708 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NfyaP23708 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NfyaP23708 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NfyaP23708 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NfyaP23708 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NfyaP23708 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NfyaP23708 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NfyaP23708 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NfyaP23708 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NfyaP23708 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NfyaP23708 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NfyaP23708 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NfyaP23708 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NfyaP23708 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NfyaP23708 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NfyaP23708 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NfyaP23708 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NfyaP23708 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NfyaP23708 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NfyaP23708 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NfyaP23708 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NfyaP23708 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
NfyaP23708 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NfyaP23708 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NfyaP23708 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NfyaP23708 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NfyaP23708 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NfyaP23708 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NfyaP23708 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NfyaP23708 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NfyaP23708 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NfyaP23708 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NfyaP23708 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NfyaP23708 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NfyaP23708 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NfyaP23708 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NfyaP23708 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NfyaP23708 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NfyaP23708 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NfyaP23708 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NfyaP23708 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NfyaP23708 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NfyaP23708 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NfyaP23708 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NfyaP23708 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NfyaP23708 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NfyaP23708 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NfyaP23708 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NfyaP23708 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NfyaP23708 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NfyaP23708 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NfyaP23708 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NfyaP23708 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NfyaP23708 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NfyaP23708 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NfyaP23708 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NfyaP23708 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NfyaP23708 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NfyaP23708 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NfyaP23708 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NfyaP23708 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NfyaP23708 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NfyaP23708 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NfyaP23708 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NfyaP23708 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NfyaP23708 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NfyaP23708 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NfyaP23708 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NfyaP23708 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.1 ms