Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
Ggta1P23336 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23,14■■□□□ 1,3
Ggta1P23336 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,14■■□□□ 1,3
Ggta1P23336 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,14■■□□□ 1,29
Ggta1P23336 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23,14■■□□□ 1,29
Ggta1P23336 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23,14■■□□□ 1,29
Ggta1P23336 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,14■■□□□ 1,29
Ggta1P23336 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23,14■■□□□ 1,29
Ggta1P23336 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,13■■□□□ 1,29
Ggta1P23336 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
Ggta1P23336 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
Ggta1P23336 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
Ggta1P23336 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
Ggta1P23336 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23,13■■□□□ 1,29
Ggta1P23336 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23,12■■□□□ 1,29
Ggta1P23336 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
Ggta1P23336 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
Ggta1P23336 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
Ggta1P23336 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,11■■□□□ 1,29
Ggta1P23336 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,1■■□□□ 1,29
Ggta1P23336 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23,1■■□□□ 1,29
Ggta1P23336 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,1■■□□□ 1,29
Ggta1P23336 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,1■■□□□ 1,29
Ggta1P23336 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
Ggta1P23336 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
Ggta1P23336 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
Ggta1P23336 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
Ggta1P23336 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,29
Ggta1P23336 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23,06■■□□□ 1,28
Ggta1P23336 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,06■■□□□ 1,28
Ggta1P23336 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23,04■■□□□ 1,28
Ggta1P23336 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23,04■■□□□ 1,28
Ggta1P23336 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
Ggta1P23336 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
Ggta1P23336 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,03■■□□□ 1,28
Ggta1P23336 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,03■■□□□ 1,28
Ggta1P23336 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,03■■□□□ 1,28
Ggta1P23336 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,03■■□□□ 1,28
Ggta1P23336 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23,02■■□□□ 1,28
Ggta1P23336 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23,02■■□□□ 1,28
Ggta1P23336 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,02■■□□□ 1,28
Ggta1P23336 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,02■■□□□ 1,28
Ggta1P23336 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
Ggta1P23336 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
Ggta1P23336 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1,27
Ggta1P23336 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22,99■■□□□ 1,27
Ggta1P23336 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22,99■■□□□ 1,27
Ggta1P23336 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,99■■□□□ 1,27
Ggta1P23336 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
Ggta1P23336 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
Ggta1P23336 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
Ggta1P23336 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22,98■■□□□ 1,27
Ggta1P23336 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
Ggta1P23336 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,97■■□□□ 1,27
Ggta1P23336 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22,97■■□□□ 1,27
Ggta1P23336 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22,96■■□□□ 1,27
Ggta1P23336 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22,96■■□□□ 1,27
Ggta1P23336 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22,95■■□□□ 1,26
Ggta1P23336 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,94■■□□□ 1,26
Ggta1P23336 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22,94■■□□□ 1,26
Ggta1P23336 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22,92■■□□□ 1,26
Ggta1P23336 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,92■■□□□ 1,26
Ggta1P23336 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
Ggta1P23336 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
Ggta1P23336 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
Ggta1P23336 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22,9■■□□□ 1,26
Ggta1P23336 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22,9■■□□□ 1,26
Ggta1P23336 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,9■■□□□ 1,26
Ggta1P23336 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,87■■□□□ 1,25
Ggta1P23336 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22,87■■□□□ 1,25
Ggta1P23336 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22,87■■□□□ 1,25
Ggta1P23336 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22,86■■□□□ 1,25
Ggta1P23336 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22,85■■□□□ 1,25
Ggta1P23336 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
Ggta1P23336 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
Ggta1P23336 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,84■■□□□ 1,25
Ggta1P23336 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,84■■□□□ 1,25
Ggta1P23336 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,84■■□□□ 1,25
Ggta1P23336 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22,83■■□□□ 1,25
Ggta1P23336 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,83■■□□□ 1,25
Ggta1P23336 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,83■■□□□ 1,25
Ggta1P23336 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22,83■■□□□ 1,25
Ggta1P23336 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,83■■□□□ 1,25
Ggta1P23336 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,82■■□□□ 1,24
Ggta1P23336 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22,82■■□□□ 1,24
Ggta1P23336 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22,82■■□□□ 1,24
Ggta1P23336 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22,82■■□□□ 1,24
Ggta1P23336 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,81■■□□□ 1,24
Ggta1P23336 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22,81■■□□□ 1,24
Ggta1P23336 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22,8■■□□□ 1,24
Ggta1P23336 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,8■■□□□ 1,24
Ggta1P23336 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22,79■■□□□ 1,24
Ggta1P23336 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22,79■■□□□ 1,24
Ggta1P23336 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,79■■□□□ 1,24
Ggta1P23336 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22,77■■□□□ 1,24
Ggta1P23336 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22,77■■□□□ 1,24
Ggta1P23336 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22,77■■□□□ 1,24
Ggta1P23336 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,77■■□□□ 1,24
Ggta1P23336 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,75■■□□□ 1,23
Ggta1P23336 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22,75■■□□□ 1,23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28,5 ms