Protein–RNA interactions for Protein: P22518

Clk1, Dual specificity protein kinase CLK1, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk1P22518 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clk1P22518 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clk1P22518 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clk1P22518 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clk1P22518 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clk1P22518 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clk1P22518 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clk1P22518 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clk1P22518 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clk1P22518 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clk1P22518 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clk1P22518 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clk1P22518 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clk1P22518 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clk1P22518 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clk1P22518 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clk1P22518 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clk1P22518 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clk1P22518 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Clk1P22518 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Clk1P22518 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clk1P22518 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clk1P22518 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clk1P22518 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clk1P22518 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clk1P22518 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clk1P22518 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clk1P22518 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clk1P22518 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Clk1P22518 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clk1P22518 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clk1P22518 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clk1P22518 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clk1P22518 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clk1P22518 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clk1P22518 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clk1P22518 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clk1P22518 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clk1P22518 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clk1P22518 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clk1P22518 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clk1P22518 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clk1P22518 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clk1P22518 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clk1P22518 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clk1P22518 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clk1P22518 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clk1P22518 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clk1P22518 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clk1P22518 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clk1P22518 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clk1P22518 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clk1P22518 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clk1P22518 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clk1P22518 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clk1P22518 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clk1P22518 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clk1P22518 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clk1P22518 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clk1P22518 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clk1P22518 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clk1P22518 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clk1P22518 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Clk1P22518 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clk1P22518 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Clk1P22518 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clk1P22518 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clk1P22518 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clk1P22518 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clk1P22518 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clk1P22518 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clk1P22518 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clk1P22518 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clk1P22518 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clk1P22518 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clk1P22518 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clk1P22518 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Clk1P22518 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Clk1P22518 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clk1P22518 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clk1P22518 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clk1P22518 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clk1P22518 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clk1P22518 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clk1P22518 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clk1P22518 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clk1P22518 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clk1P22518 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clk1P22518 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clk1P22518 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clk1P22518 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clk1P22518 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clk1P22518 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clk1P22518 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Clk1P22518 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clk1P22518 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Clk1P22518 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Clk1P22518 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clk1P22518 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clk1P22518 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms