Protein–RNA interactions for Protein: P20937

Klra1, T-cell surface glycoprotein YE1/48, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klra1P20937 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Klra1P20937 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Klra1P20937 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Klra1P20937 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Klra1P20937 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Klra1P20937 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Klra1P20937 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Klra1P20937 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Klra1P20937 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Klra1P20937 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Klra1P20937 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Klra1P20937 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Klra1P20937 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Klra1P20937 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Klra1P20937 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Klra1P20937 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Klra1P20937 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Klra1P20937 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Klra1P20937 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Klra1P20937 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Klra1P20937 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Klra1P20937 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Klra1P20937 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Klra1P20937 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Klra1P20937 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Klra1P20937 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Klra1P20937 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Klra1P20937 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Klra1P20937 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Klra1P20937 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Klra1P20937 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Klra1P20937 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Klra1P20937 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Klra1P20937 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Klra1P20937 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Klra1P20937 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Klra1P20937 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Klra1P20937 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Klra1P20937 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Klra1P20937 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Klra1P20937 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Klra1P20937 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Klra1P20937 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Klra1P20937 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Klra1P20937 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Klra1P20937 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Klra1P20937 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Klra1P20937 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Klra1P20937 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Klra1P20937 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Klra1P20937 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Klra1P20937 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Klra1P20937 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Klra1P20937 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Klra1P20937 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Klra1P20937 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Klra1P20937 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Klra1P20937 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Klra1P20937 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Klra1P20937 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Klra1P20937 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Klra1P20937 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Klra1P20937 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Klra1P20937 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Klra1P20937 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Klra1P20937 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Klra1P20937 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Klra1P20937 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Klra1P20937 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Klra1P20937 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Klra1P20937 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Klra1P20937 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Klra1P20937 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Klra1P20937 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Klra1P20937 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Klra1P20937 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Klra1P20937 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Klra1P20937 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Klra1P20937 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Klra1P20937 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Klra1P20937 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Klra1P20937 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Klra1P20937 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Klra1P20937 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Klra1P20937 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Klra1P20937 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Klra1P20937 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Klra1P20937 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Klra1P20937 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Klra1P20937 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Klra1P20937 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Klra1P20937 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Klra1P20937 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Klra1P20937 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Klra1P20937 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Klra1P20937 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Klra1P20937 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Klra1P20937 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Klra1P20937 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Klra1P20937 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms