Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ifrd1P19182 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ifrd1P19182 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ifrd1P19182 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ifrd1P19182 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ifrd1P19182 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ifrd1P19182 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ifrd1P19182 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ifrd1P19182 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ifrd1P19182 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ifrd1P19182 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ifrd1P19182 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ifrd1P19182 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ifrd1P19182 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ifrd1P19182 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Ifrd1P19182 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ifrd1P19182 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ifrd1P19182 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ifrd1P19182 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ifrd1P19182 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ifrd1P19182 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ifrd1P19182 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ifrd1P19182 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ifrd1P19182 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ifrd1P19182 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ifrd1P19182 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ifrd1P19182 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ifrd1P19182 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ifrd1P19182 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ifrd1P19182 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ifrd1P19182 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ifrd1P19182 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ifrd1P19182 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ifrd1P19182 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ifrd1P19182 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ifrd1P19182 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ifrd1P19182 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ifrd1P19182 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ifrd1P19182 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ifrd1P19182 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ifrd1P19182 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ifrd1P19182 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ifrd1P19182 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ifrd1P19182 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ifrd1P19182 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ifrd1P19182 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ifrd1P19182 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ifrd1P19182 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ifrd1P19182 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ifrd1P19182 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ifrd1P19182 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ifrd1P19182 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ifrd1P19182 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ifrd1P19182 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ifrd1P19182 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ifrd1P19182 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ifrd1P19182 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ifrd1P19182 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ifrd1P19182 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ifrd1P19182 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ifrd1P19182 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ifrd1P19182 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ifrd1P19182 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ifrd1P19182 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ifrd1P19182 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ifrd1P19182 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ifrd1P19182 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ifrd1P19182 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ifrd1P19182 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ifrd1P19182 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ifrd1P19182 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ifrd1P19182 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ifrd1P19182 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ifrd1P19182 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ifrd1P19182 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ifrd1P19182 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ifrd1P19182 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ifrd1P19182 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ifrd1P19182 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ifrd1P19182 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ifrd1P19182 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ifrd1P19182 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ifrd1P19182 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ifrd1P19182 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ifrd1P19182 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ifrd1P19182 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ifrd1P19182 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ifrd1P19182 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ifrd1P19182 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ifrd1P19182 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ifrd1P19182 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ifrd1P19182 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ifrd1P19182 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ifrd1P19182 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ifrd1P19182 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ifrd1P19182 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ifrd1P19182 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ifrd1P19182 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ifrd1P19182 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ifrd1P19182 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms