Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tnnc1P19123 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tnnc1P19123 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tnnc1P19123 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tnnc1P19123 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tnnc1P19123 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tnnc1P19123 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tnnc1P19123 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tnnc1P19123 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tnnc1P19123 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tnnc1P19123 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tnnc1P19123 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Tnnc1P19123 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tnnc1P19123 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tnnc1P19123 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Tnnc1P19123 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tnnc1P19123 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tnnc1P19123 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tnnc1P19123 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tnnc1P19123 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tnnc1P19123 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tnnc1P19123 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tnnc1P19123 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tnnc1P19123 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tnnc1P19123 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tnnc1P19123 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tnnc1P19123 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tnnc1P19123 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tnnc1P19123 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tnnc1P19123 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tnnc1P19123 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tnnc1P19123 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tnnc1P19123 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tnnc1P19123 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tnnc1P19123 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Tnnc1P19123 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tnnc1P19123 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tnnc1P19123 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tnnc1P19123 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tnnc1P19123 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tnnc1P19123 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tnnc1P19123 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tnnc1P19123 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Tnnc1P19123 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tnnc1P19123 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tnnc1P19123 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tnnc1P19123 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tnnc1P19123 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tnnc1P19123 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tnnc1P19123 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tnnc1P19123 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Tnnc1P19123 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tnnc1P19123 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tnnc1P19123 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tnnc1P19123 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Tnnc1P19123 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Tnnc1P19123 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tnnc1P19123 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tnnc1P19123 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tnnc1P19123 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tnnc1P19123 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Tnnc1P19123 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tnnc1P19123 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tnnc1P19123 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tnnc1P19123 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tnnc1P19123 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tnnc1P19123 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tnnc1P19123 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tnnc1P19123 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tnnc1P19123 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tnnc1P19123 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tnnc1P19123 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tnnc1P19123 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tnnc1P19123 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tnnc1P19123 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tnnc1P19123 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tnnc1P19123 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tnnc1P19123 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tnnc1P19123 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tnnc1P19123 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Tnnc1P19123 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tnnc1P19123 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Tnnc1P19123 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tnnc1P19123 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tnnc1P19123 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tnnc1P19123 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tnnc1P19123 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tnnc1P19123 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tnnc1P19123 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tnnc1P19123 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tnnc1P19123 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Tnnc1P19123 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tnnc1P19123 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tnnc1P19123 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tnnc1P19123 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Tnnc1P19123 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tnnc1P19123 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tnnc1P19123 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tnnc1P19123 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tnnc1P19123 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms