Protein–RNA interactions for Protein: P18654

Rps6ka3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka3P18654 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rps6ka3P18654 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rps6ka3P18654 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rps6ka3P18654 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rps6ka3P18654 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rps6ka3P18654 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rps6ka3P18654 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Rps6ka3P18654 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rps6ka3P18654 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rps6ka3P18654 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rps6ka3P18654 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rps6ka3P18654 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rps6ka3P18654 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rps6ka3P18654 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rps6ka3P18654 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rps6ka3P18654 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Rps6ka3P18654 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rps6ka3P18654 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rps6ka3P18654 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rps6ka3P18654 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rps6ka3P18654 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rps6ka3P18654 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rps6ka3P18654 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rps6ka3P18654 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rps6ka3P18654 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Rps6ka3P18654 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Rps6ka3P18654 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rps6ka3P18654 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Rps6ka3P18654 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rps6ka3P18654 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rps6ka3P18654 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Rps6ka3P18654 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Rps6ka3P18654 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rps6ka3P18654 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rps6ka3P18654 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rps6ka3P18654 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rps6ka3P18654 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rps6ka3P18654 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rps6ka3P18654 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rps6ka3P18654 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rps6ka3P18654 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rps6ka3P18654 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Rps6ka3P18654 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rps6ka3P18654 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rps6ka3P18654 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rps6ka3P18654 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rps6ka3P18654 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rps6ka3P18654 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rps6ka3P18654 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rps6ka3P18654 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rps6ka3P18654 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rps6ka3P18654 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rps6ka3P18654 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rps6ka3P18654 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rps6ka3P18654 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rps6ka3P18654 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rps6ka3P18654 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rps6ka3P18654 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rps6ka3P18654 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rps6ka3P18654 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rps6ka3P18654 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rps6ka3P18654 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rps6ka3P18654 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rps6ka3P18654 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rps6ka3P18654 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rps6ka3P18654 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rps6ka3P18654 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rps6ka3P18654 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rps6ka3P18654 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rps6ka3P18654 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rps6ka3P18654 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rps6ka3P18654 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rps6ka3P18654 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rps6ka3P18654 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rps6ka3P18654 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rps6ka3P18654 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rps6ka3P18654 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rps6ka3P18654 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rps6ka3P18654 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rps6ka3P18654 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rps6ka3P18654 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rps6ka3P18654 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rps6ka3P18654 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rps6ka3P18654 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rps6ka3P18654 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rps6ka3P18654 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rps6ka3P18654 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rps6ka3P18654 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rps6ka3P18654 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rps6ka3P18654 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rps6ka3P18654 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rps6ka3P18654 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rps6ka3P18654 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rps6ka3P18654 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rps6ka3P18654 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rps6ka3P18654 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rps6ka3P18654 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rps6ka3P18654 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rps6ka3P18654 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rps6ka3P18654 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms