Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rps6ka1P18653 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rps6ka1P18653 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rps6ka1P18653 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rps6ka1P18653 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rps6ka1P18653 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rps6ka1P18653 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rps6ka1P18653 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rps6ka1P18653 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rps6ka1P18653 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rps6ka1P18653 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rps6ka1P18653 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rps6ka1P18653 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rps6ka1P18653 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rps6ka1P18653 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rps6ka1P18653 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rps6ka1P18653 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rps6ka1P18653 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Rps6ka1P18653 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rps6ka1P18653 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rps6ka1P18653 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Rps6ka1P18653 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rps6ka1P18653 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rps6ka1P18653 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rps6ka1P18653 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rps6ka1P18653 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rps6ka1P18653 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Rps6ka1P18653 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rps6ka1P18653 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rps6ka1P18653 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rps6ka1P18653 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Rps6ka1P18653 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Rps6ka1P18653 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rps6ka1P18653 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rps6ka1P18653 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rps6ka1P18653 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rps6ka1P18653 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rps6ka1P18653 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rps6ka1P18653 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rps6ka1P18653 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rps6ka1P18653 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rps6ka1P18653 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rps6ka1P18653 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rps6ka1P18653 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rps6ka1P18653 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rps6ka1P18653 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rps6ka1P18653 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rps6ka1P18653 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rps6ka1P18653 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rps6ka1P18653 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rps6ka1P18653 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rps6ka1P18653 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rps6ka1P18653 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rps6ka1P18653 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rps6ka1P18653 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rps6ka1P18653 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Rps6ka1P18653 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rps6ka1P18653 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rps6ka1P18653 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rps6ka1P18653 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rps6ka1P18653 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rps6ka1P18653 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rps6ka1P18653 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rps6ka1P18653 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rps6ka1P18653 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rps6ka1P18653 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rps6ka1P18653 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rps6ka1P18653 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rps6ka1P18653 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rps6ka1P18653 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rps6ka1P18653 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rps6ka1P18653 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rps6ka1P18653 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rps6ka1P18653 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rps6ka1P18653 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rps6ka1P18653 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rps6ka1P18653 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rps6ka1P18653 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rps6ka1P18653 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rps6ka1P18653 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rps6ka1P18653 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Rps6ka1P18653 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rps6ka1P18653 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rps6ka1P18653 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rps6ka1P18653 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rps6ka1P18653 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rps6ka1P18653 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rps6ka1P18653 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rps6ka1P18653 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rps6ka1P18653 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rps6ka1P18653 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Rps6ka1P18653 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Rps6ka1P18653 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rps6ka1P18653 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rps6ka1P18653 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rps6ka1P18653 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rps6ka1P18653 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rps6ka1P18653 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rps6ka1P18653 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rps6ka1P18653 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms