Protein–RNA interactions for Protein: P18527

Ig heavy chain V region 914, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18527 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P18527 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
P18527 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
P18527 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
P18527 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P18527 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P18527 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P18527 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P18527 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
P18527 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P18527 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P18527 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P18527 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
P18527 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
P18527 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
P18527 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
P18527 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
P18527 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
P18527 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
P18527 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
P18527 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
P18527 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
P18527 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P18527 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P18527 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P18527 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
P18527 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P18527 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P18527 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P18527 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P18527 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
P18527 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P18527 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
P18527 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P18527 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
P18527 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
P18527 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P18527 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
P18527 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
P18527 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
P18527 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
P18527 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
P18527 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
P18527 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P18527 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
P18527 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P18527 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P18527 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P18527 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
P18527 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
P18527 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
P18527 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
P18527 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
P18527 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
P18527 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
P18527 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
P18527 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
P18527 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
P18527 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
P18527 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
P18527 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
P18527 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
P18527 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
P18527 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
P18527 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
P18527 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
P18527 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
P18527 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
P18527 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
P18527 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
P18527 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
P18527 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
P18527 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P18527 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P18527 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P18527 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P18527 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P18527 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P18527 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
P18527 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P18527 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
P18527 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
P18527 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P18527 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P18527 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P18527 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P18527 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
P18527 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P18527 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P18527 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P18527 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P18527 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P18527 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P18527 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P18527 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P18527 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P18527 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P18527 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P18527 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P18527 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 222.3 ms