Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gata1P17679 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gata1P17679 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gata1P17679 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gata1P17679 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gata1P17679 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gata1P17679 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gata1P17679 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gata1P17679 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gata1P17679 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gata1P17679 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gata1P17679 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gata1P17679 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gata1P17679 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gata1P17679 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gata1P17679 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gata1P17679 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gata1P17679 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gata1P17679 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gata1P17679 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gata1P17679 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gata1P17679 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gata1P17679 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gata1P17679 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gata1P17679 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gata1P17679 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gata1P17679 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gata1P17679 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gata1P17679 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gata1P17679 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gata1P17679 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gata1P17679 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gata1P17679 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gata1P17679 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gata1P17679 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gata1P17679 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Gata1P17679 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gata1P17679 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gata1P17679 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gata1P17679 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gata1P17679 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gata1P17679 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gata1P17679 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gata1P17679 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gata1P17679 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gata1P17679 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gata1P17679 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gata1P17679 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gata1P17679 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gata1P17679 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gata1P17679 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gata1P17679 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Gata1P17679 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gata1P17679 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gata1P17679 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gata1P17679 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gata1P17679 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gata1P17679 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gata1P17679 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gata1P17679 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gata1P17679 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gata1P17679 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gata1P17679 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gata1P17679 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gata1P17679 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gata1P17679 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gata1P17679 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gata1P17679 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gata1P17679 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gata1P17679 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gata1P17679 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gata1P17679 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gata1P17679 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gata1P17679 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gata1P17679 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gata1P17679 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gata1P17679 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gata1P17679 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gata1P17679 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gata1P17679 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gata1P17679 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gata1P17679 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gata1P17679 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gata1P17679 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gata1P17679 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gata1P17679 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gata1P17679 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gata1P17679 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gata1P17679 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gata1P17679 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gata1P17679 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gata1P17679 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gata1P17679 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gata1P17679 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gata1P17679 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gata1P17679 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gata1P17679 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gata1P17679 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gata1P17679 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gata1P17679 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms