Protein–RNA interactions for Protein: P16014

Chgb, Secretogranin-1, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgbP16014 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ChgbP16014 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ChgbP16014 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ChgbP16014 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ChgbP16014 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ChgbP16014 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ChgbP16014 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ChgbP16014 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ChgbP16014 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ChgbP16014 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ChgbP16014 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ChgbP16014 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ChgbP16014 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ChgbP16014 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ChgbP16014 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ChgbP16014 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ChgbP16014 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ChgbP16014 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ChgbP16014 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ChgbP16014 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ChgbP16014 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ChgbP16014 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ChgbP16014 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ChgbP16014 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ChgbP16014 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ChgbP16014 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ChgbP16014 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ChgbP16014 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ChgbP16014 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ChgbP16014 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ChgbP16014 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ChgbP16014 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ChgbP16014 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ChgbP16014 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ChgbP16014 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ChgbP16014 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ChgbP16014 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ChgbP16014 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ChgbP16014 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ChgbP16014 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ChgbP16014 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ChgbP16014 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ChgbP16014 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ChgbP16014 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ChgbP16014 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ChgbP16014 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ChgbP16014 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ChgbP16014 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ChgbP16014 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ChgbP16014 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ChgbP16014 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ChgbP16014 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ChgbP16014 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ChgbP16014 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ChgbP16014 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ChgbP16014 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ChgbP16014 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ChgbP16014 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ChgbP16014 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ChgbP16014 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ChgbP16014 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ChgbP16014 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ChgbP16014 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ChgbP16014 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ChgbP16014 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ChgbP16014 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ChgbP16014 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ChgbP16014 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ChgbP16014 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ChgbP16014 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ChgbP16014 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ChgbP16014 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ChgbP16014 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ChgbP16014 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ChgbP16014 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ChgbP16014 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ChgbP16014 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ChgbP16014 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ChgbP16014 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ChgbP16014 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ChgbP16014 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ChgbP16014 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ChgbP16014 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ChgbP16014 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ChgbP16014 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ChgbP16014 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ChgbP16014 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ChgbP16014 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ChgbP16014 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ChgbP16014 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ChgbP16014 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ChgbP16014 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ChgbP16014 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ChgbP16014 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ChgbP16014 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ChgbP16014 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ChgbP16014 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ChgbP16014 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ChgbP16014 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ChgbP16014 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms