Protein–RNA interactions for Protein: P14576

Srp54, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54P14576 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Srp54P14576 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Srp54P14576 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Srp54P14576 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Srp54P14576 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Srp54P14576 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Srp54P14576 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Srp54P14576 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Srp54P14576 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Srp54P14576 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Srp54P14576 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Srp54P14576 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Srp54P14576 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Srp54P14576 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Srp54P14576 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Srp54P14576 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Srp54P14576 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Srp54P14576 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Srp54P14576 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Srp54P14576 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Srp54P14576 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Srp54P14576 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Srp54P14576 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Srp54P14576 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Srp54P14576 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Srp54P14576 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Srp54P14576 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Srp54P14576 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Srp54P14576 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Srp54P14576 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Srp54P14576 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Srp54P14576 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Srp54P14576 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Srp54P14576 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Srp54P14576 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Srp54P14576 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Srp54P14576 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Srp54P14576 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Srp54P14576 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Srp54P14576 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Srp54P14576 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Srp54P14576 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Srp54P14576 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Srp54P14576 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Srp54P14576 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Srp54P14576 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Srp54P14576 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Srp54P14576 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Srp54P14576 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Srp54P14576 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Srp54P14576 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Srp54P14576 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Srp54P14576 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Srp54P14576 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Srp54P14576 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Srp54P14576 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Srp54P14576 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Srp54P14576 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Srp54P14576 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Srp54P14576 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Srp54P14576 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Srp54P14576 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Srp54P14576 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Srp54P14576 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Srp54P14576 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Srp54P14576 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Srp54P14576 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Srp54P14576 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Srp54P14576 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Srp54P14576 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Srp54P14576 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Srp54P14576 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Srp54P14576 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Srp54P14576 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Srp54P14576 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Srp54P14576 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Srp54P14576 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Srp54P14576 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Srp54P14576 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Srp54P14576 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Srp54P14576 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Srp54P14576 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Srp54P14576 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Srp54P14576 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Srp54P14576 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Srp54P14576 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Srp54P14576 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Srp54P14576 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Srp54P14576 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Srp54P14576 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Srp54P14576 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Srp54P14576 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Srp54P14576 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Srp54P14576 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Srp54P14576 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Srp54P14576 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Srp54P14576 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Srp54P14576 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Srp54P14576 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Srp54P14576 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms