Protein–RNA interactions for Protein: P14106

C1qb, Complement C1q subcomponent subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qbP14106 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1qbP14106 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1qbP14106 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1qbP14106 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1qbP14106 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1qbP14106 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1qbP14106 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1qbP14106 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1qbP14106 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1qbP14106 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1qbP14106 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
C1qbP14106 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1qbP14106 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C1qbP14106 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1qbP14106 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1qbP14106 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1qbP14106 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1qbP14106 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1qbP14106 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
C1qbP14106 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1qbP14106 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1qbP14106 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1qbP14106 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1qbP14106 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1qbP14106 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1qbP14106 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1qbP14106 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C1qbP14106 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1qbP14106 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1qbP14106 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1qbP14106 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1qbP14106 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1qbP14106 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1qbP14106 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1qbP14106 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1qbP14106 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1qbP14106 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1qbP14106 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1qbP14106 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1qbP14106 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1qbP14106 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C1qbP14106 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1qbP14106 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1qbP14106 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1qbP14106 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1qbP14106 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1qbP14106 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1qbP14106 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1qbP14106 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1qbP14106 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1qbP14106 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1qbP14106 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1qbP14106 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1qbP14106 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1qbP14106 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1qbP14106 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1qbP14106 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1qbP14106 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1qbP14106 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1qbP14106 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1qbP14106 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1qbP14106 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1qbP14106 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1qbP14106 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1qbP14106 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1qbP14106 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1qbP14106 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1qbP14106 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1qbP14106 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1qbP14106 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1qbP14106 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1qbP14106 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1qbP14106 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1qbP14106 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1qbP14106 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1qbP14106 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1qbP14106 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
C1qbP14106 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1qbP14106 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1qbP14106 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1qbP14106 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1qbP14106 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1qbP14106 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1qbP14106 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1qbP14106 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1qbP14106 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1qbP14106 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1qbP14106 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1qbP14106 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1qbP14106 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1qbP14106 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1qbP14106 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
C1qbP14106 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1qbP14106 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1qbP14106 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1qbP14106 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1qbP14106 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1qbP14106 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1qbP14106 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1qbP14106 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms