Protein–RNA interactions for Protein: P13412

Tnni2, Troponin I, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni2P13412 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Tnni2P13412 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Tnni2P13412 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Tnni2P13412 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29,61■■■□□ 2,33
Tnni2P13412 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Tnni2P13412 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,6■■■□□ 2,33
Tnni2P13412 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC29,6■■■□□ 2,33
Tnni2P13412 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Tnni2P13412 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29,56■■■□□ 2,32
Tnni2P13412 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Tnni2P13412 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,55■■■□□ 2,32
Tnni2P13412 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Tnni2P13412 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29,54■■■□□ 2,32
Tnni2P13412 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC29,54■■■□□ 2,32
Tnni2P13412 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Tnni2P13412 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Tnni2P13412 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29,53■■■□□ 2,32
Tnni2P13412 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC29,52■■■□□ 2,32
Tnni2P13412 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
Tnni2P13412 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
Tnni2P13412 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Tnni2P13412 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Tnni2P13412 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Tnni2P13412 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,47■■■□□ 2,31
Tnni2P13412 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Tnni2P13412 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Tnni2P13412 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Tnni2P13412 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,46■■■□□ 2,31
Tnni2P13412 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
Tnni2P13412 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC29,45■■■□□ 2,31
Tnni2P13412 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,3
Tnni2P13412 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,3
Tnni2P13412 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Tnni2P13412 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC29,43■■■□□ 2,3
Tnni2P13412 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29,42■■■□□ 2,3
Tnni2P13412 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Tnni2P13412 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Tnni2P13412 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC29,4■■■□□ 2,3
Tnni2P13412 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Tnni2P13412 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29,39■■■□□ 2,3
Tnni2P13412 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Tnni2P13412 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,29
Tnni2P13412 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29,39■■■□□ 2,29
Tnni2P13412 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,38■■■□□ 2,29
Tnni2P13412 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Tnni2P13412 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Tnni2P13412 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29,35■■■□□ 2,29
Tnni2P13412 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Tnni2P13412 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC29,34■■■□□ 2,29
Tnni2P13412 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Tnni2P13412 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Tnni2P13412 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Tnni2P13412 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Tnni2P13412 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Tnni2P13412 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Tnni2P13412 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Tnni2P13412 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC29,31■■■□□ 2,28
Tnni2P13412 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC29,3■■■□□ 2,28
Tnni2P13412 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,29■■■□□ 2,28
Tnni2P13412 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Tnni2P13412 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Tnni2P13412 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Tnni2P13412 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Tnni2P13412 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Tnni2P13412 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Tnni2P13412 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC29,27■■■□□ 2,28
Tnni2P13412 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Tnni2P13412 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Tnni2P13412 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Tnni2P13412 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Tnni2P13412 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Tnni2P13412 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Tnni2P13412 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,26
Tnni2P13412 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Tnni2P13412 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Tnni2P13412 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,18■■■□□ 2,26
Tnni2P13412 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Tnni2P13412 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,18■■■□□ 2,26
Tnni2P13412 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Tnni2P13412 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Tnni2P13412 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Tnni2P13412 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Tnni2P13412 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Tnni2P13412 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC29,12■■■□□ 2,25
Tnni2P13412 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC29,11■■■□□ 2,25
Tnni2P13412 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC29,08■■■□□ 2,25
Tnni2P13412 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Tnni2P13412 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29,06■■■□□ 2,24
Tnni2P13412 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Tnni2P13412 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,06■■■□□ 2,24
Tnni2P13412 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Tnni2P13412 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC29,06■■■□□ 2,24
Tnni2P13412 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29,05■■■□□ 2,24
Tnni2P13412 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,05■■■□□ 2,24
Tnni2P13412 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Tnni2P13412 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Tnni2P13412 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Tnni2P13412 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Tnni2P13412 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Tnni2P13412 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20,7 ms