Protein–RNA interactions for Protein: P12672

Rapsn, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RapsnP12672 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RapsnP12672 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RapsnP12672 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RapsnP12672 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RapsnP12672 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RapsnP12672 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RapsnP12672 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RapsnP12672 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RapsnP12672 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RapsnP12672 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RapsnP12672 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RapsnP12672 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RapsnP12672 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RapsnP12672 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RapsnP12672 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RapsnP12672 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RapsnP12672 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RapsnP12672 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RapsnP12672 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RapsnP12672 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RapsnP12672 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RapsnP12672 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RapsnP12672 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RapsnP12672 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RapsnP12672 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RapsnP12672 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RapsnP12672 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RapsnP12672 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RapsnP12672 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RapsnP12672 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RapsnP12672 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RapsnP12672 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RapsnP12672 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RapsnP12672 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RapsnP12672 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RapsnP12672 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RapsnP12672 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RapsnP12672 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RapsnP12672 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RapsnP12672 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RapsnP12672 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RapsnP12672 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RapsnP12672 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RapsnP12672 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RapsnP12672 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RapsnP12672 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RapsnP12672 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RapsnP12672 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RapsnP12672 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RapsnP12672 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RapsnP12672 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RapsnP12672 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RapsnP12672 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RapsnP12672 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RapsnP12672 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RapsnP12672 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RapsnP12672 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RapsnP12672 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RapsnP12672 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RapsnP12672 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RapsnP12672 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RapsnP12672 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RapsnP12672 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RapsnP12672 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RapsnP12672 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RapsnP12672 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RapsnP12672 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RapsnP12672 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RapsnP12672 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RapsnP12672 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RapsnP12672 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RapsnP12672 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RapsnP12672 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RapsnP12672 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RapsnP12672 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RapsnP12672 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RapsnP12672 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RapsnP12672 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RapsnP12672 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RapsnP12672 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RapsnP12672 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RapsnP12672 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RapsnP12672 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RapsnP12672 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RapsnP12672 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RapsnP12672 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RapsnP12672 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RapsnP12672 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RapsnP12672 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RapsnP12672 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RapsnP12672 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RapsnP12672 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RapsnP12672 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RapsnP12672 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RapsnP12672 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RapsnP12672 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RapsnP12672 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RapsnP12672 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RapsnP12672 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RapsnP12672 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms