Protein–RNA interactions for Protein: P10287

Cdh3, Cadherin-3, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh3P10287 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdh3P10287 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdh3P10287 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdh3P10287 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdh3P10287 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdh3P10287 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdh3P10287 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdh3P10287 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdh3P10287 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdh3P10287 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdh3P10287 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdh3P10287 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdh3P10287 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdh3P10287 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdh3P10287 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdh3P10287 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdh3P10287 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdh3P10287 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdh3P10287 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdh3P10287 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdh3P10287 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdh3P10287 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdh3P10287 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdh3P10287 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdh3P10287 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdh3P10287 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdh3P10287 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdh3P10287 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdh3P10287 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdh3P10287 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdh3P10287 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdh3P10287 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdh3P10287 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdh3P10287 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdh3P10287 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdh3P10287 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdh3P10287 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdh3P10287 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdh3P10287 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdh3P10287 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdh3P10287 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdh3P10287 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdh3P10287 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdh3P10287 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdh3P10287 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdh3P10287 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdh3P10287 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdh3P10287 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdh3P10287 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdh3P10287 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdh3P10287 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdh3P10287 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdh3P10287 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdh3P10287 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdh3P10287 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdh3P10287 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdh3P10287 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdh3P10287 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cdh3P10287 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cdh3P10287 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdh3P10287 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdh3P10287 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdh3P10287 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdh3P10287 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdh3P10287 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdh3P10287 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdh3P10287 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdh3P10287 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdh3P10287 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdh3P10287 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdh3P10287 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdh3P10287 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdh3P10287 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdh3P10287 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdh3P10287 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdh3P10287 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdh3P10287 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdh3P10287 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdh3P10287 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdh3P10287 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdh3P10287 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdh3P10287 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh3P10287 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh3P10287 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdh3P10287 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdh3P10287 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdh3P10287 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdh3P10287 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdh3P10287 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdh3P10287 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdh3P10287 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdh3P10287 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdh3P10287 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdh3P10287 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdh3P10287 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdh3P10287 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdh3P10287 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdh3P10287 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdh3P10287 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdh3P10287 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.9 ms