Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxb4P10284 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxb4P10284 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxb4P10284 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxb4P10284 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hoxb4P10284 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxb4P10284 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxb4P10284 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxb4P10284 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxb4P10284 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxb4P10284 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxb4P10284 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxb4P10284 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxb4P10284 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxb4P10284 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxb4P10284 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxb4P10284 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxb4P10284 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxb4P10284 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxb4P10284 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxb4P10284 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxb4P10284 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxb4P10284 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxb4P10284 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxb4P10284 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxb4P10284 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxb4P10284 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxb4P10284 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxb4P10284 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxb4P10284 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxb4P10284 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxb4P10284 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxb4P10284 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxb4P10284 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxb4P10284 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxb4P10284 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxb4P10284 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxb4P10284 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hoxb4P10284 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxb4P10284 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxb4P10284 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxb4P10284 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxb4P10284 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxb4P10284 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxb4P10284 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxb4P10284 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxb4P10284 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxb4P10284 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxb4P10284 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxb4P10284 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxb4P10284 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxb4P10284 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxb4P10284 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxb4P10284 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxb4P10284 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxb4P10284 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxb4P10284 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxb4P10284 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxb4P10284 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxb4P10284 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxb4P10284 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Hoxb4P10284 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxb4P10284 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxb4P10284 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxb4P10284 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxb4P10284 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxb4P10284 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxb4P10284 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxb4P10284 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxb4P10284 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxb4P10284 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxb4P10284 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxb4P10284 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxb4P10284 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxb4P10284 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxb4P10284 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxb4P10284 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxb4P10284 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxb4P10284 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxb4P10284 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxb4P10284 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxb4P10284 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxb4P10284 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxb4P10284 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxb4P10284 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxb4P10284 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxb4P10284 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxb4P10284 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxb4P10284 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxb4P10284 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxb4P10284 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxb4P10284 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxb4P10284 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxb4P10284 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxb4P10284 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxb4P10284 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxb4P10284 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxb4P10284 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxb4P10284 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxb4P10284 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms