Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Dnmt3cP0DOY1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Dnmt3cP0DOY1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Dnmt3cP0DOY1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Dnmt3cP0DOY1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Dnmt3cP0DOY1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Dnmt3cP0DOY1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Dnmt3cP0DOY1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Dnmt3cP0DOY1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Dnmt3cP0DOY1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Dnmt3cP0DOY1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Dnmt3cP0DOY1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Dnmt3cP0DOY1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Dnmt3cP0DOY1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Dnmt3cP0DOY1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Dnmt3cP0DOY1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Dnmt3cP0DOY1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Dnmt3cP0DOY1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Dnmt3cP0DOY1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Dnmt3cP0DOY1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Dnmt3cP0DOY1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Dnmt3cP0DOY1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Dnmt3cP0DOY1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Dnmt3cP0DOY1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Dnmt3cP0DOY1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Dnmt3cP0DOY1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Dnmt3cP0DOY1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Dnmt3cP0DOY1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Dnmt3cP0DOY1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Dnmt3cP0DOY1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Dnmt3cP0DOY1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Dnmt3cP0DOY1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Dnmt3cP0DOY1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Dnmt3cP0DOY1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Dnmt3cP0DOY1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Dnmt3cP0DOY1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Dnmt3cP0DOY1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Dnmt3cP0DOY1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Dnmt3cP0DOY1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Dnmt3cP0DOY1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Dnmt3cP0DOY1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dnmt3cP0DOY1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Dnmt3cP0DOY1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Dnmt3cP0DOY1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dnmt3cP0DOY1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dnmt3cP0DOY1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dnmt3cP0DOY1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Dnmt3cP0DOY1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Dnmt3cP0DOY1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dnmt3cP0DOY1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dnmt3cP0DOY1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Dnmt3cP0DOY1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Dnmt3cP0DOY1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Dnmt3cP0DOY1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dnmt3cP0DOY1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dnmt3cP0DOY1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dnmt3cP0DOY1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dnmt3cP0DOY1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dnmt3cP0DOY1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dnmt3cP0DOY1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Dnmt3cP0DOY1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Dnmt3cP0DOY1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Dnmt3cP0DOY1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Dnmt3cP0DOY1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Dnmt3cP0DOY1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dnmt3cP0DOY1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Dnmt3cP0DOY1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Dnmt3cP0DOY1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dnmt3cP0DOY1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dnmt3cP0DOY1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dnmt3cP0DOY1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dnmt3cP0DOY1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dnmt3cP0DOY1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dnmt3cP0DOY1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dnmt3cP0DOY1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dnmt3cP0DOY1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dnmt3cP0DOY1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Dnmt3cP0DOY1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Dnmt3cP0DOY1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Dnmt3cP0DOY1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dnmt3cP0DOY1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dnmt3cP0DOY1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dnmt3cP0DOY1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dnmt3cP0DOY1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dnmt3cP0DOY1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dnmt3cP0DOY1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dnmt3cP0DOY1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dnmt3cP0DOY1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dnmt3cP0DOY1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dnmt3cP0DOY1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dnmt3cP0DOY1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dnmt3cP0DOY1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dnmt3cP0DOY1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dnmt3cP0DOY1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dnmt3cP0DOY1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Dnmt3cP0DOY1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dnmt3cP0DOY1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dnmt3cP0DOY1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dnmt3cP0DOY1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dnmt3cP0DOY1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms