Protein–RNA interactions for Protein: P0DOV2

Ifi204, Interferon-activable protein 204, mousemouse

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi204P0DOV2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ifi204P0DOV2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ifi204P0DOV2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ifi204P0DOV2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ifi204P0DOV2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ifi204P0DOV2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ifi204P0DOV2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ifi204P0DOV2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ifi204P0DOV2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ifi204P0DOV2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ifi204P0DOV2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ifi204P0DOV2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ifi204P0DOV2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ifi204P0DOV2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ifi204P0DOV2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ifi204P0DOV2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ifi204P0DOV2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ifi204P0DOV2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ifi204P0DOV2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ifi204P0DOV2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ifi204P0DOV2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ifi204P0DOV2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ifi204P0DOV2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ifi204P0DOV2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ifi204P0DOV2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ifi204P0DOV2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ifi204P0DOV2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ifi204P0DOV2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ifi204P0DOV2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ifi204P0DOV2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ifi204P0DOV2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ifi204P0DOV2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ifi204P0DOV2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ifi204P0DOV2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ifi204P0DOV2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ifi204P0DOV2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ifi204P0DOV2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ifi204P0DOV2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ifi204P0DOV2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ifi204P0DOV2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ifi204P0DOV2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ifi204P0DOV2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ifi204P0DOV2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ifi204P0DOV2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ifi204P0DOV2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ifi204P0DOV2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ifi204P0DOV2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ifi204P0DOV2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ifi204P0DOV2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ifi204P0DOV2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ifi204P0DOV2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ifi204P0DOV2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ifi204P0DOV2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ifi204P0DOV2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ifi204P0DOV2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ifi204P0DOV2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ifi204P0DOV2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ifi204P0DOV2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ifi204P0DOV2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ifi204P0DOV2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ifi204P0DOV2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ifi204P0DOV2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ifi204P0DOV2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ifi204P0DOV2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ifi204P0DOV2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ifi204P0DOV2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ifi204P0DOV2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ifi204P0DOV2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ifi204P0DOV2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ifi204P0DOV2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ifi204P0DOV2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ifi204P0DOV2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ifi204P0DOV2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ifi204P0DOV2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ifi204P0DOV2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ifi204P0DOV2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ifi204P0DOV2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ifi204P0DOV2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ifi204P0DOV2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ifi204P0DOV2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ifi204P0DOV2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ifi204P0DOV2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ifi204P0DOV2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ifi204P0DOV2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ifi204P0DOV2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ifi204P0DOV2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ifi204P0DOV2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ifi204P0DOV2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ifi204P0DOV2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ifi204P0DOV2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ifi204P0DOV2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ifi204P0DOV2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ifi204P0DOV2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ifi204P0DOV2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ifi204P0DOV2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ifi204P0DOV2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ifi204P0DOV2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ifi204P0DOV2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ifi204P0DOV2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ifi204P0DOV2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms