Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UbbP0CG49 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UbbP0CG49 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UbbP0CG49 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UbbP0CG49 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UbbP0CG49 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UbbP0CG49 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UbbP0CG49 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UbbP0CG49 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UbbP0CG49 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UbbP0CG49 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
UbbP0CG49 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UbbP0CG49 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
UbbP0CG49 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UbbP0CG49 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UbbP0CG49 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UbbP0CG49 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UbbP0CG49 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UbbP0CG49 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UbbP0CG49 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.28■■□□□ 1
UbbP0CG49 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UbbP0CG49 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UbbP0CG49 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UbbP0CG49 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
UbbP0CG49 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UbbP0CG49 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UbbP0CG49 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UbbP0CG49 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UbbP0CG49 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UbbP0CG49 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UbbP0CG49 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UbbP0CG49 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UbbP0CG49 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UbbP0CG49 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UbbP0CG49 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UbbP0CG49 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UbbP0CG49 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UbbP0CG49 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UbbP0CG49 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UbbP0CG49 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UbbP0CG49 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UbbP0CG49 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UbbP0CG49 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UbbP0CG49 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UbbP0CG49 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
UbbP0CG49 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
UbbP0CG49 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UbbP0CG49 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UbbP0CG49 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UbbP0CG49 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
UbbP0CG49 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
UbbP0CG49 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UbbP0CG49 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UbbP0CG49 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UbbP0CG49 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UbbP0CG49 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UbbP0CG49 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UbbP0CG49 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
UbbP0CG49 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UbbP0CG49 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UbbP0CG49 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UbbP0CG49 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UbbP0CG49 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UbbP0CG49 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UbbP0CG49 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UbbP0CG49 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
UbbP0CG49 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UbbP0CG49 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UbbP0CG49 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UbbP0CG49 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UbbP0CG49 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UbbP0CG49 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UbbP0CG49 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UbbP0CG49 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
UbbP0CG49 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UbbP0CG49 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UbbP0CG49 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UbbP0CG49 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
UbbP0CG49 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UbbP0CG49 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UbbP0CG49 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UbbP0CG49 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UbbP0CG49 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UbbP0CG49 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UbbP0CG49 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UbbP0CG49 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UbbP0CG49 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UbbP0CG49 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UbbP0CG49 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UbbP0CG49 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UbbP0CG49 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UbbP0CG49 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UbbP0CG49 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UbbP0CG49 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UbbP0CG49 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UbbP0CG49 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UbbP0CG49 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UbbP0CG49 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UbbP0CG49 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UbbP0CG49 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms