Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ifna9P09235 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ifna9P09235 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ifna9P09235 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ifna9P09235 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ifna9P09235 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ifna9P09235 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ifna9P09235 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Ifna9P09235 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ifna9P09235 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ifna9P09235 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ifna9P09235 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ifna9P09235 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ifna9P09235 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ifna9P09235 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ifna9P09235 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ifna9P09235 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ifna9P09235 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ifna9P09235 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ifna9P09235 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ifna9P09235 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ifna9P09235 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ifna9P09235 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ifna9P09235 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ifna9P09235 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ifna9P09235 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ifna9P09235 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ifna9P09235 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ifna9P09235 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ifna9P09235 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ifna9P09235 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ifna9P09235 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ifna9P09235 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ifna9P09235 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ifna9P09235 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ifna9P09235 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ifna9P09235 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ifna9P09235 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ifna9P09235 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ifna9P09235 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ifna9P09235 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ifna9P09235 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ifna9P09235 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ifna9P09235 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ifna9P09235 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ifna9P09235 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ifna9P09235 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ifna9P09235 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ifna9P09235 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ifna9P09235 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ifna9P09235 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ifna9P09235 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ifna9P09235 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ifna9P09235 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ifna9P09235 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ifna9P09235 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ifna9P09235 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Ifna9P09235 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Ifna9P09235 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ifna9P09235 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ifna9P09235 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ifna9P09235 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ifna9P09235 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ifna9P09235 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ifna9P09235 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ifna9P09235 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ifna9P09235 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ifna9P09235 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ifna9P09235 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ifna9P09235 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ifna9P09235 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ifna9P09235 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ifna9P09235 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ifna9P09235 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ifna9P09235 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ifna9P09235 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ifna9P09235 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ifna9P09235 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ifna9P09235 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ifna9P09235 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ifna9P09235 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ifna9P09235 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ifna9P09235 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ifna9P09235 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ifna9P09235 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ifna9P09235 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ifna9P09235 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ifna9P09235 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ifna9P09235 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ifna9P09235 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ifna9P09235 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ifna9P09235 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ifna9P09235 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ifna9P09235 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ifna9P09235 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ifna9P09235 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ifna9P09235 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ifna9P09235 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ifna9P09235 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ifna9P09235 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms